我们如何根据树状图中形成的集群将 hclust 的标签放在表中答案

【问题标题】：How can we put label of hclust in table according to clusters formed in dendogram我们如何根据树状图中形成的集群将 hclust 的标签放在表中
【发布时间】：2020-07-19 16:11:46
【问题描述】：

我有一个树状图，其中包含许多叶节点/标签的集群如何根据使用 R

形成的集群将这些 hclust 标签放在表中

【问题讨论】：

嗨，我添加了一些代码，展示了如何将集群名称粘贴到矢量元素中
感谢您的帮助。
如果答案解决了您的问题，请随时接受。
虽然克里斯的回答是有效的，但我认为这不是正确的答案。你应该使用cutree，请看我的回复。

标签： r dendrogram hclust

【解决方案1】：

我相信更直接的方法是使用cutree（而不是通过rect.dendrogram）：

> d1 <- USArrests[1:10,]
> d1 <- USArrests[1:10,]
> hc <- hclust(dist(d1))
> hcc <- cutree(hc, k = 3)
> hcc
    Alabama      Alaska     Arizona    Arkansas  California 
          1           1           2           1           2 
   Colorado Connecticut    Delaware     Florida     Georgia 
          1           3           1           2           1 
> data.frame(d1, hcc)
            Murder Assault UrbanPop Rape hcc
Alabama       13.2     236       58 21.2   1
Alaska        10.0     263       48 44.5   1
Arizona        8.1     294       80 31.0   2
Arkansas       8.8     190       50 19.5   1
California     9.0     276       91 40.6   2
Colorado       7.9     204       78 38.7   1
Connecticut    3.3     110       77 11.1   3
Delaware       5.9     238       72 15.8   1
Florida       15.4     335       80 31.9   2
Georgia       17.4     211       60 25.8   1

专业提示：如果您使用的是 dendrogram 而不是 hclut，您可以使用 dendextend 包来获得用于 dendrogram 的 cutree。

【讨论】：

【解决方案2】：

您需要访问存储在您的rect.hclust 对象中的数据，如下所示：

obj <- rect.hclust(my_matrix, k = n)
str(obj)

通过使用str 检查obj，您将找到按集群分组的所有变量的列表。您可以将它们导出为表格形式，例如使用lapply：

labels <- lapply(obj, paste0, collapse = ",")

【讨论】：