使用 r 自动选择 .csv 文件中的行和列答案

【问题标题】：Selecting rows and columns within .csv file automatically using r使用 r 自动选择 .csv 文件中的行和列
【发布时间】：2019-07-24 10:53:15
【问题描述】：

所以我为我的论文创建了一个数据库，我想比较不同情况下的物质以获得 P 值。为了做到这一点，我在 R 中创建了一个不是自动的脚本。我对如何使用for 循环创建一个为我执行此操作的脚本非常感兴趣。我想为每一行但每三列选择组。

如果可能，请告诉我。提前致谢！

现在我正在这样做。首先选择第 1 行的前三个值，然后在第一行选择接下来的三个值，以便在下一步中进行比较。

row1_1 <- my_data[1, 2:4]
row1_2 <- my_data[1, 6:8]

【问题讨论】：

in order to compare them 是什么意思？
我想将 1A、1B、1C 与 2A、2B、2C 进行比较。为了做到这一点，我使用具有两个输入 t.test((values 1A, 1B, 1C), (2A, 2B, 2C)) 的函数。然而，为每一行执行此操作需要大量重复代码，我想使用 for 循环来自动化这些代码。所以：对于 i in row，选择 1A、1B、1C，选择 2A、2B、2C。这对你们来说清楚吗？

标签： r dataframe compare p-value

【解决方案1】：

根据问题，以下将使用 for 循环遍历每一行

for (i in 1:nrow(my_data))
{

case1<- my_data[i, 2:4]
case2<- my_data[i, 6:8]
compare_cases <- t.test(case1, case2, alternative = "two.sided", var.equal = FALSE) 
print(case1)
print(case2)
print(compare_cases)
}

基于 cmets 的带有错误处理的修改变体

pvalues <- c()
for (i in 1:nrow(my_data))
{

  case1<- my_data[i, 2:4]
  case2<- my_data[i, 6:8]
  pval <- NA
  test <- tryCatch({ t.test(case1, case2, alternative = "two.sided", var.equal = FALSE) }, 
                     warning = function(war) { NA },
                     error = function(err) { NA },
                     finally = { })
  print(paste0("Test for row i=",i))
  print(test)
  if (identical(test,NA)) pval <- NA
  else pval <- test$p.value

  pvalues <- c(pvalues,pval)
}

print("All my pvalues for all rows are:")
print(pvalues)

【讨论】：

我认为这在读取数据后有效。 OP 似乎想在read.csv 或任何阅读功能中做到这一点。
对于我想将这些选定值相互比较的每一行。我想使用函数 t.test(first3values, second3values) 并为每一行重复这个 t.test
我上面提供的解决方案似乎可以解决您的问题（您需要插入您的 t.test() 调用，其中推荐说#do compare stuff）。
for (i in 1:nrow(my_data)) { case1 <- my_data[i, 2:4] case2 <- my_data[i, 6:8] compare_cases <- t.test(case1, case2, alternative = "two.sided", var.equal = FALSE) print(case1) print(case2) print(compare_cases) }
目前我有这段代码，但它仍然无法工作......抱歉给您带来不便