【发布时间】:2020-11-21 13:39:47
【问题描述】:
我想在 Pfam_domains 列中检索至少提到一次的所有名称。
这是我的数据框:
TCID Fonction Genbank Uniprot Pfam_domains
0 3.A.1.1.1 MalE MalE P0AEX9 PF00528
1 3.A.1.1.1 MalF MalF P02916 PF01547
2 3.A.1.1.1 MalG MalG P68183 PF00528
3 3.A.1.1.1 MalK MalK P68187 PF00005
4 3.A.1.1.1 MalK MalK P68187 PF17912
.. ... ... ... ... ...
178 3.A.1.5.32 LAC30SC_07295 LAC30SC_07295 F0TFS7 PF00528
179 3.A.1.5.32 LAC30SC_07300 LAC30SC_07300 F0TFS8 PF00528
180 3.A.1.5.32 LAC30SC_07305 LAC30SC_07305 F0TFS9 PF00005
181 3.A.1.5.32 LAC30SC_07305 LAC30SC_07305 F0TFS9 PF08352
182 3.A.1.5.32 LAC30SC_07310 LAC30SC_07310 F0TFT0 PF00005
这是我的代码:
for i in range(1, len(df)-1):
unite=pd.unique(df['Pfam_domains'][i])
这里的问题是我只列出了所有域(所有域的所有出现)。
这是我希望输出的内容:
"PF00528"
"PF01547"
"PF00005"
...
【问题讨论】:
-
我认为您只是在寻找
df.Pfam_domains.unique(),无需遍历每一行 -
或者试试:
df.Pfam_domains.value_counts() -
实际上,循环不是必需的。感谢您的帮助。
标签: python pandas dataframe unique col