【问题标题】:How to do an exponential regression model?如何做指数回归模型?
【发布时间】:2021-05-06 03:21:33
【问题描述】:

我有一个小的data base(txt 文件)。

我想在 R 中获得指数回归。

我使用的命令是:

regression <- read.delim("C:/Users/david/OneDrive/Desktop/regression.txt")
View(regression)
source('~/.active-rstudio-document', echo=TRUE)
m <- nls(DelSqRho ~ (1-exp(-a*(d-b)**2)), data=regression, start=list(a=1, b=1))
y_est<-predict(m,regression$d)
plot(x,y)
lines(x,y_est)
summary(m)

但是,当我运行它时,我得到一个错误:

Error in nls(DelSqRho ~ (1 - exp(-a * (d - b)^2)), data = regression,  : 
  step factor 0.000488281 reduced below 'minFactor' of 0.000976562

我不知道如何解决,如何获得指数回归,请问有什么提示吗?

【问题讨论】:

  • ... 在这种情况下,您可以通过拟合 start_m = lm(log(1/(1-DelSqRho)) ~ poly(d, 2, raw=TRUE), regression)(这是您的模型方程重新排列)并获取 a = coef(start_m)[3]b = sqrt(coef(start_m)[1]/coef(start_m)[3]) 来了解启动参数
  • @user20650 谢谢你的回答,但我没有得到正确的答案,我尝试了start_m = lm(log(1/(1-DelSqRho)) ~ poly(d, 2, raw=TRUE), regression);;;;;; y_est&lt;-predict(start_m,regression$DelSqRho),我得到了Error in eval(predvars, data, env) : numeric 'envir' arg not of length one

标签: r regression exponential nls


【解决方案1】:

nls 对起始参数的值非常敏感,因此您希望选择能够合理拟合数据的值(minpack.lm::nlsLM 可以更宽容一些)。

您可以在 a=1b=1 的起始值处绘制曲线,并发现它不能很好地捕获曲线。

regression <- read.delim("regression.txt")
with(regression, plot(d, DelSqRho, ylim=c(-3, 1)))
xs <- seq(min(regression$d), max(regression$d), length=100)
a <- 1; b <- 1; ys <- 1 - exp(-a* (xs - b)**2)
lines(xs, ys)

获得起始值的一种方法是重新排列目标函数。 y = 1 - exp(-a*(x-b)**2) 可以重新排列为log(1/(1-y)) = ab^2 - 2abx + ax^2(这里y 必须小于一)。然后可以使用线性回归来估计 ab

start_m <- lm(log(1/(1-DelSqRho)) ~ poly(d, 2, raw=TRUE), regression)
unname(a <- coef(start_m)[3]) # as `a` is aligned with the quadratic term
# [1] -0.2345953 
unname(b <- sqrt(coef(start_m)[1]/coef(start_m)[3]))
# [1] 2.933345 

(有时无法以这种方式重新排列数据,您可以尝试通过在各种起始参数处绘制曲线来大致了解参数。nls2 也可以进行蛮力搜索或网格搜索超过启动参数。)

我们现在可以尝试在这些参数下估计nls 模型:

m <- nls(DelSqRho ~ 1-exp(-a*(d-b)**2), data=regression, start=list(a=a, b=b))
coef(m)
#          a          b 
# -0.2379078  2.8868374 

并绘制结果:

# note that `newdata` must be a named list or data frame 
# in which to look for variables with which to predict.
y_est <- predict(m, newdata=data.frame(d=xs))
with(regression, plot(d, DelSqRho))
lines(xs, y_est, col="red", lwd=2)

拟合度不是很好,可能暗示需要更灵活的模型。

【讨论】:

  • 谢谢你,我都试过了,但是最后一个命令块不起作用,它提示我Error in data.frame(d = xs) : object 'xs' not found
  • 另一个化学家; xs 在第一个代码块中定义
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