【问题标题】:Correct model in R using lmer使用 lmer 在 R 中正确模型
【发布时间】:2023-03-25 06:35:01
【问题描述】:

我有一个关于在 R 中使用 lmer 正确设置模型的问题。

这是一个重复测量实验

每位受试者(共 20 名)针对每种刺激条件(阳极、阴极和假手术)完成 4 项不同的任务。因变量是反应时间(rt)

我使用了这个模型,但我不确定它是否正确。我更关心随机效应是否正确分配

model<- lmer(rt ~ task * stimulation + (task * stimulation|subject), data=dat)

任何帮助将不胜感激。

谢谢

【问题讨论】:

    标签: r statistics lme4 mixed-models


    【解决方案1】:

    我不得不不同意引用 Barr 等人 (2013) 来“保持最大”的另一个答案。在很多情况下,这已被证明是一个糟糕的建议,以至于 lme4 的作者引入了代码来检查奇异拟合。不仅如此,Doug Bates(lme4 的主要作者,可能是混合模型的世界领先权威)和同事在 2015 年写了一篇论文,专门解决了“保持最大”的愿望所带来的问题 - Parsimonious Mixed Models。

    当然,我并不是说检查单数拟合是一件坏事——这是一件好事,所以肯定会从中得到一些好处。

    所以在这种情况下,我们有(task * stimulation|subject),其中task 有 4 个级别,stimulation 有 3 个级别,因此我们要求软件仅用 20 个受试者估计 8 个方差-协方差参数。我并不是说这是不可能的,但在我看来,以此为目标似乎很奇怪。 Bates 等人(2015 年)的论文非常详细地介绍了如何处理由此产生的问题,我已经回答了一些关于如何处理问题的 CV 问题here 和 here

    所以总而言之,另一个答案不一定是错误的,但它可能会导致很多问题。

    【讨论】:

    【解决方案2】:

    这对我来说看起来不错。您目前拥有所谓的“最大”随机效应结构(即,所有估计的固定效应都有随机效应)。这是更可取的依据:

    Barr, D. J.、Levy, R.、Scheepers, C. 和 Tily, H. J. (2013)。验证性假设检验的随机效应结构:保持最大。记忆和语言杂志,68(3),255-278。

    【讨论】:

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