我可以在命令行中运行 Jupyter 笔记本单元格吗？答案

【问题标题】：Can I run Jupyter notebook cells in commandline?我可以在命令行中运行 Jupyter 笔记本单元格吗？
【发布时间】：2016-05-30 01:17:47
【问题描述】：

我正在部署一个 Python 包，我想运行一个简单的测试，看看我笔记本中的所有单元格是否都能正常运行。我想通过命令行对此进行测试，因为我在virtualenv 中运行笔记本时遇到问题。有没有简单的命令行方法来测试这个？

版主注意：此问题已被标记为与How to run an .ipynb Jupyter Notebook from terminal? 重复。但是，这个问题是在那个问题之前几天发布的（2016 年 2 月 18 日 2:49 提问）（16 年 2 月 22 日 3:35 提问）。最多，该帖子可能会被标记为重复，如果认为是这样，适当的操作将是merge the two questions, maintaining this, the original, as the master。

但是，这些问题可能不会重复（其他作者的意图不清楚）。无论如何，这个问题及其答案专门针对从终端执行 jupyter notebook 中的单元，而不是简单地将 notebook 转换为 python 文件。

【问题讨论】：

【解决方案1】：

nbconvert（一个用于笔记本转换的 jupyter 工具）让您无需任何额外的包即可做到这一点：

只需转到您的终端并输入

$ jupyter nbconvert --to notebook --inplace --execute mynotebook.ipynb

（感谢 Stephan 建议 --inplace 标志）

注意：也就是说，我会尝试将您需要的所有内容转换为适当的脚本。 Jupyter 笔记本被认为是用于探索和分享结果，而不是替代传统程序。

【讨论】：

我更喜欢使用 nbconvert 的想法而不是单独的包，尽管当我尝试这个时遇到了this issue
您也可以使用 --inplace 标志：jupyter nbconvert --to notebook --execute --inplace mynotebook.ipynb
如果任何单元的运行时间超过 30 秒，Nbconvert 将失败，您可能需要添加 --ExecutePreprocessor.timeout=600。
可以在nbconvert.readthedocs.io/en/latest/…找到运行笔记本的文档或这种和编程方式。
@bckygldstn 有什么办法可以一起取消超时？还是我只需要设置一个非常高的值？

【解决方案2】：

您可以使用runipy 来执行此操作。

runipy 将运行笔记本中的所有单元格。如果发生错误，进程将停止。

$ pip install runipy

$ runipy MyNotebook.ipynb

还有一些命令可以将输出文件保存为笔记本或 html 报告：

$ runipy MyNotebook.ipynb OutputNotebook.ipynb

$ runipy MyNotebook.ipynb --html report.html

【讨论】：

【解决方案3】：

您也可以尝试papermill，它允许您从命令行执行笔记本，并传递参数：

例如：

$ papermill mynotebook.ipynb mynotebook_output.ipynb -p start "2017-11-01" -p end "2017-11-30"

你也可以不传递任何参数运行它。

【讨论】：