如何将 conda 环境“克隆”到根环境中？

Question

我希望 conda 的根环境将所有包复制到另一个环境中。如何才能做到这一点？

Answer 1

可以选择将依赖项名称/url/版本复制到文件中。

推荐

通常，在新环境中工作比更改root 更安全。但是，请考虑在尝试更改之前备份现有环境。通过在演示环境中测试这些命令来验证所需的结果。例如，备份您的 root 环境：

λ conda activate root
λ conda env export > environment_root.yml
λ conda list --explicit > spec_file_root.txt

选项

选项 1 - YAML 文件

在第二个环境中（例如myenv），export names⁺ 到一个 yaml 文件：

λ activate myenv
λ conda env export > environment.yml  

然后update the first environment⁺（例如root）与yaml文件：

λ conda env update --name root --file environment.yml     

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选项 2 - 克隆环境

使用--clone 标志克隆环境（参见@DevC 的帖子）：

λ conda create --name myclone --clone root

这基本上是创建环境的直接副本。

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选项 3 - 规范文件

创建一个spec-file⁺⁺ 以附加来自环境的依赖项（请参阅@Ormetrom）：

λ activate myenv
λ conda list --explicit > spec_file.txt
λ conda install --name root --file spec_file.txt

或者，复制一个新环境（推荐）：

λ conda create --name myenv2 --file spec_file.txt

另见

• conda env 了解有关 env 子命令的更多详细信息。
• Anaconada Navigator 桌面程序，提供更加图形化的体验。
• Docs 更新命令。对于较旧的 conda 版本，请使用 activate (Windows) 和 source activate (Linux/Mac OS)。较新版本的 conda 可以使用 conda activate（这可能需要通过 conda init 对您的 shell 配置进行一些设置）。
• Discussion 保持conda env

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附加内容

似乎有一个未记录的 conda run 选项可帮助在特定环境中执行命令。

# New command
λ conda run --name myenv conda list --explicit > spec_file.txt

后一个命令在没有激活/停用步骤的环境中运行命令时有效。请参阅下面的等效命令：

# Equivalent
λ activate myenv
λ conda list --explicit > spec_file.txt
λ deactivate

请注意，这可能是一项实验性功能，因此在正式采用公共 API 之前，这可能不适合生产环境。

^{+自原始帖子以来，Conda 文档发生了变化；链接已更新。++规范文件仅适用于在同一操作系统上创建的环境。与前两个选项不同，spec-files 仅捕获指向 conda 依赖项的链接；不包括 pip 依赖项。}

Answer 2

要复制您的根环境（名为base），您可以使用以下命令；使用 Anaconda3-5.0.1 为我工作：

conda create --name <env_name> --clone base

您可以使用以下命令列出所有安装在 conda 环境中的包

conda list -n <env_name>

Answer 3

当设置一个新环境时，我需要新环境中的基本环境中的包（通常是这种情况），我在提示符下使用 spec-file.txt 构建一个相同的 conda 环境：

conda list --explicit > spec-file.txt

spec 文件包括例如基础环境的包。

然后使用提示将软件包安装到新环境中：

conda create --name myenv --file spec-file.txt

base 中的包随后在新环境中可用。

整个过程在文档中有描述： https://docs.conda.io/projects/conda/en/latest/user-guide/tasks/manage-environments.html#building-identical-conda-environments

Answer 4

我还遇到了将环境克隆到另一台机器上的麻烦，并想提供一个答案。我遇到的关键问题是当当前环境包含无法直接从conda install 或pip install 获得的开发包时解决错误。对于这些情况，我强烈推荐conda-pack（见this answer）：

pip install conda-pack

或者，

conda install conda-pack

然后备份环境，使用当前环境只需省略 my_env 名称，

# Pack environment my_env into my_env.tar.gz
$ conda pack -n my_env

# Pack environment my_env into out_name.tar.gz
$ conda pack -n my_env -o out_name.tar.gz

# Pack environment located at an explicit path into my_env.tar.gz
$ conda pack -p /explicit/path/to/my_env

和恢复，

# Unpack environment into directory `my_env`
$ mkdir -p my_env
$ tar -xzf my_env.tar.gz -C my_env

# Use Python without activating or fixing the prefixes. Most Python
# libraries will work fine, but things that require prefix cleanups
# will fail.
$ ./my_env/bin/python

# Activate the environment. This adds `my_env/bin` to your path
$ source my_env/bin/activate

# Run Python from in the environment
(my_env) $ python

# Cleanup prefixes from in the active environment.
# Note that this command can also be run without activating the environment
# as long as some version of Python is already installed on the machine.
(my_env) $ conda-unpack