Knitr 在 RStudio 中同时编译和运行

Question

要在 RStudio 中运行 Rnw 文件，可以编译 或全部运行。编译看不到当前环境中的变量，当前环境看不到编译时创建的变量。我想看看编译时输出的样子，并使用环境调试代码。这需要我编译和运行，两次执行相同的计算，这对于大型项目来说是非常不切实际的。有没有办法编译并在环境中看到输出？

Answer 1

当您编织文档时，工作发生在不同的 R 会话中，这就是您无法在当前会话中检查结果的原因。

但是除了run all，你还有很多选择。看一下 Run 按钮：它允许您一次运行一个块，或运行所有以前的块等。

如果您的某些块运行时间过长，那么您应该考虑以不同的方式组织您的工作。将长计算放入他们自己的脚本中，并使用save() 保存该脚本的结果。运行一次，然后花时间在主 .Rnw 文档中多次运行编辑这些结果的显示。

最后，如果您真的想在小插图运行结束时查看变量，您可以在最后添加save.image(file = 'vignette.RData')，并在您的交互会话中使用load('vignette.RData') 加载值以供检查。这不一定会在运行结束时为您提供准确的事物状态视图，因为它会加载除了您已经在工作区中获得的任何内容之外的值，它不会加载选项设置或附加包，但它可能足以用于调试。