从 node.js 调用 Rscript答案

【问题标题】：calling an Rscript from node.js从 node.js 调用 Rscript
【发布时间】：2017-06-08 17:01:53
【问题描述】：

我一直在尝试从我的 node.js 服务器执行 Rscript。试图在网上跟随一个例子，但我一直得到一个空返回的对象，或者有时这个过程会一直运行下去。我在下面提到了代码 sn-p。谢谢。

example.js ::

var R = require("r-script");


var out = R("scripts/testScript.R")
        .data("hello world", 20)
        .callSync(function(err,resp){
                      console.log(out);
                   });

testScript.R 文件 :::

needs(magrittr)
set.seed(512)
do.call(rep, input) %>% 
strsplit(NULL) %>% 
sapply(sample) %>% 
apply(2, paste, collapse = "")

【问题讨论】：

如果你使用一个只打印“hello”的普通 R 程序怎么办？
哪个进程永远运行，R进程还是node进程？另外我认为您尝试在.callSync 的回调中记录一个在函数返回之前未定义的变量可能是一个问题。
我这里有一个例子，但没有使用r-script:github.com/stla/CallingRinNode

标签： r node.js rscript node.js-stream

【解决方案1】：

Windows 用户：

您需要将环境变量添加到 Windows 的 %PATH% 变量中。 R-script 包需要从 CMD 调用“R”命令。如果 R.exe 没有设置为环境变量，那么它将永远无法从任何地方调用“R”命令。

查看如何将环境变量添加到 Windows，并记住：如果包含可执行文件的文件夹的路径有空格，则必须在双引号之间添加空格。 "C:\Program Files\R\R-3.3.2\bin\x64"

如果你已经这样做了，但问题仍然存在，我只能想到两个原因：

你的 R 方法有问题，它在 R 会话中给出了一个内部异常。
系统找不到文件。也许检查文件路径。

【讨论】：

【解决方案2】：

您可以在节点中使用子进程来调用其他语言。我发现从节点调用 Python 最简单，然后使用 Python 的 subprocess 模块调用 R：

节点

var spawn = require("child_process").spawn

var process = spawn('python',["call_r.py", script_choice, function_choice]);

这会调用我们的 call_r.py 文件，并传递我们的 script 和 function 选项：

PYTHON (call_r.py)

import subprocess
import sys

script_choice = sys.argv[1]
function_choice = sys.argv[2]

call_script = 'R_Scripts/' + script_choice + '.R'
cmd = ['Rscript', call_script] + [function_choice]
result = subprocess.check_output(cmd, universal_newlines=True)

print(result)
sys.stdout.flush()

这会解析传递的脚本和函数选择，通过 Python 的 subprocess 模块调用 R。

R（选择的脚本）

myArgs <- commandArgs(trailingOnly = TRUE)
function_choice <- myArgs[1]

# add your R functions here

eval(parse(text=function_choice))

在这里，R 解析传递的函数选择并对其进行评估。请注意，只需将参数包含在函数参数中即可将参数传递给所选的 R 函数（例如 my_function('hey there')）

【讨论】：