无法从 Rscript 批处理文件调用 roxygenize 函数答案

【问题标题】：Cannot call roxygenize function from Rscript batch file无法从 Rscript 批处理文件调用 roxygenize 函数
【发布时间】：2012-02-16 09:10:34
【问题描述】：

我正在编写一个脚本，它使用 roxygen2 自动对我的包进行 roxygenize。我希望它是可执行的，以便它可以成为准备和安装包的更大脚本的一部分，但由于某种原因我不能使它与 Rscript 一起使用。

代码如下：

#!/usr/bin/env Rscript
library(roxygen2)
roxygenize('.', copy=FALSE)

如果我启动交互式 R 会话或使用 R CMD BATCH 提交代码，这将正常工作。但是，如果我通过 Rscript 直接将脚本作为可执行文件运行，我会得到这个输出和错误（无论脚本是在当前目录还是 bin 中，我都会得到错误）。

bin/roxygenize.R 
Loading required package: digest
Warning message:
package 'roxygen2' was built under R version 2.13.2 
Error in parse.files(r_files) : could not find function "setPackageName"
Calls: roxygenize -> parse.files
Execution halted

看起来 setPackageName 在 base R 中，所以我不知道为什么它不存在。此外，我在许多其他情况下使用 Rscript，这似乎是唯一失败的地方。

非常感谢任何帮助。

【问题讨论】：

这是 roxygen 中的一个错误。在下一个版本发布之前，通过显式加载方法和实用程序来解决它。
谢谢，哈德利。不知道为什么让我发疯。

标签： r roxygen2 rscript

【解决方案1】：

在加载 roxygen2 和调用 roxygenize() 之前显式加载包 methods 和 utils。

#!/usr/bin/env Rscript
library(methods)
library(utils)
library(roxygen2)
roxygenize('.', copy=FALSE)

【讨论】：