将值附加到 R 中调用 shell 命令的文件答案

【问题标题】：Append values to a file in R invoking shell commands将值附加到 R 中调用 shell 命令的文件
【发布时间】：2017-07-14 17:13:50
【问题描述】：

我在 linux 上循环运行 Rscript 40 次。每次运行时，它都会生成一些我应该附加到文件中的统计信息。该文件应该有一个附加了 40 次的所有统计信息表。这是我的代码：
mean_data <- mean(m)
minimum <- min(m)
maximum <- max(m)
standard_daviation <- sd(m)
Range <- range(m)
file <- "map1"
x <-data.frame(file, mean_data,minimum,maximum,Range,standard_deviation)
system2("echo", args = paste0(" ", x ," >> tab_1.txt" ))

预期结果为：
file mean_data minimum maximum Range standard_deviation
[1] map1 1349 1100 1600 500 45
[2] map2 1242 1291 1628 337 38

但结果是：
[1] 1349 1100 1600 500 45
[2] 1242 1291 1628 337 38

使用 write.table 对我来说不是一个好选择，因为我无法每次都附加这些值。我在 shell 中使用上述代码运行脚本，循环 40 次。

【问题讨论】：

标签： r append rscript

【解决方案1】：

在write.table 中使用append=TRUE。

append

合乎逻辑。仅当文件是字符串时才相关。如果为 TRUE，则将输出附加到文件中。如果为 FALSE，则该名称的任何现有文件都将被销毁。

df <- data.frame(file, mean_data,minimum,maximum,Range,standard_deviation)
if(!file.exists("filename.txt")) {
    write.table(df, "filename.txt", col.names=TRUE)
} else {
    write.table(df, "filename.txt", col.names=FALSE, append=TRUE)
}

【讨论】：