有什么方法可以从 lme4 mer 模型拟合对象生成 LaTeX 表？答案

【问题标题】：Any way to produce a LaTeX table from an lme4 mer model fit object?有什么方法可以从 lme4 mer 模型拟合对象生成 LaTeX 表？
【发布时间】：2011-07-24 14:08:27
【问题描述】：

有没有人知道如何从 lme4 mer 对象生成高质量的发布质量 LaTeX 表？ xtable 方法（包xtable）和latex 方法（包Hmisc）都不知道如何处理mer 对象。

例如，给定这个拟合：

library(lme4)    
fm1 <- lmer(Reaction ~ Days + (Days|Subject), sleepstudy)

是否有任何选项可以为固定效应和随机效应生成一个漂亮的 LaTeX 系数估计表？

编辑：

因为这有点隐藏在下面的评论线程中，请注意社区 wiki 正在为 R LaTeX 表开发：Tools for making latex tables in R

【问题讨论】：

xtable 可以将矩阵和数据框作为输入。为什么不直接从模型中提取感兴趣的数量并将它们作为矩阵提供给 xtable 呢？或者，尝试 apsrtable。它有一个很好的扩展系统，可以很容易地添加新模型。
@Vincent，这通常是我做的，如果重复做，我会写一个函数。
wiki 上的工具当然适用于固定效果，但不适用于随机效果。在后者上寻找 OP 的答案。
对于 HTML tables 和 plots，请检查 sjPlot 包。
你试过stargazer包吗？

标签： r latex lme4

【解决方案1】：

这是一篇似乎是为这种情况量身定做的博文 Latex Tables for lme4 Models

【讨论】：

+1 感谢链接。我正忙着自己重写它，但显然这已经完成了。
@乔里斯。乳胶表上有很多针对不同型号的优秀代码，但我认为它们的传播范围很广。我一直在考虑发布一个社区 wiki 以将所有资源收集到一个地方，但我认为我没有必要的声誉点来做到这一点。您认为这会引起您的兴趣吗？
@Joris，请创建一个社区 wiki，LaTeX 表格确实是必须的。
@aL3xa：我在这里创建了一个社区 wiki：stackoverflow.com/questions/5465314/… 它还不是一个 wiki，但它很快就被标记为版主应该将其转换为 wiki。我需要 10000 个代表才能做到这一点，所以我还差 320 个……
我们想在这里建立一个知识库，而不仅仅是一个链接集合。如果您能在答案中提取链接文章的精髓，您的答案会更好。

【解决方案2】：

我可能有一个 hacky 解决方案。我想要同样的东西，特别是来自 glmer 模型拟合的系数表（估计值、SE、z 和 p 值）。找到摘要输出的正确部分并将其输入 xtable 似乎已经成功了。很抱歉没有提供可重现的代码和数据，但来自您的原始示例：

fm1 <- lmer(Reaction ~ Days + (Days|Subject), sleepstudy)
xtable(summary(fm1)@coef)

应该给你系数表、SEs等。注意它只是给出了值，而不是重要星等的额外修饰。

【讨论】：

coef(summary(fm1)) 优于 summary(fm1)@coef -- 它应该适用于任何版本的 lme4

【解决方案3】：

答案可能有点晚，但也许有人会觉得它很有趣：

library("texreg")
texreg(fm1)

要并排排版多个 lme4 或其他模型，请使用以下内容：

texreg(list(fm1, fm2))

【讨论】：