【问题标题】:Tidy Evaluation: How to use dplyr::na_if as an optional argument in a custom function that relies on a %>% pipe整洁的评估:如何在依赖 %>% 管道的自定义函数中使用 dplyr::na_if 作为可选参数
【发布时间】:2021-01-17 02:13:29
【问题描述】:

我正在尝试编写一个函数,该函数接受一个数据帧,将一列从 chr 转换为 dbl,然后将一列加 1。我还想可选地将某些值替换为NA。否则,如果不使用相关参数,我希望函数跳过 NA 替换步骤。

数据

library(tibble)
library(dplyr)
library(magrittr)

df <-
  tibble(id = 1:10, col_of_interest = 21:30) %>%
  add_row(id = 11, col_of_interest = 999) %>%
  mutate(across(col_of_interest, as.character))

df

## # A tibble: 11 x 2
##       id col_of_interest
##    <dbl> <chr>          
##  1     1 21             
##  2     2 22             
##  3     3 23             
##  4     4 24             
##  5     5 25             
##  6     6 26             
##  7     7 27             
##  8     8 28             
##  9     9 29             
## 10    10 30             
## 11    11 999  

编写函数

函数应该:

  1. 接收数据。
  2. col_of_interestchr 转换为dbl
  3. 999 替换为 NA 但前提是我指定应将 999 替换为 NA
  4. 1 添加到col_of_interest

我的尝试

在编写函数时,我参考了两个资源:

  1. 使用 {{ var }} 将数据变量传递到函数参数中,如 here 所述。
  2. if的使用基于this answer
add_one <- function(data, var, na_if_val = NULL) {

  data %>%

    mutate(across({{ var  }}, as.numeric)) %>%
    
    {if( is.null( {{ na_if_val }} )
    ) .  # <--- the dot means: "return the preexisting dataframe"

      else

        na_if( {{ na_if_val }} )

    } %>%
    
    mutate(across({{ var  }}, add, 1))
}

当我在 df 对象上测试该函数时,我得到一个错误。

add_one(data = df,
        var = col_of_interest,
        na_if_val = "999")

Error in check_length(y, x, fmt_args("y"), glue("same as {fmt_args(~x)}")) : argument "y" is missing, with no default

谷歌搜索这个错误产生了this page,说明:

但是请注意,na_if() 只能接受长度为 1 的参数。

但是,在 add_one 函数的管道中仅合并 na_if( {{ na_if_val }} ) 确实有效。条件评估与is.null 相结合会导致函数中断。我不明白为什么。

【问题讨论】:

    标签: r function dplyr tidyeval


    【解决方案1】:

    您有几个问题,但主要是因为您的非标准评估错误。

    add_one <- function(data, var, na_if_val = NULL) {
      
      var_b <- enquo(var)
      
      data <- data %>%
        mutate(across(!!var_b, as.numeric)) 
      
       if(!is.null(na_if_val)){
         data <- data %>% 
           mutate(across(!!var_b, na_if, y = na_if_val))
       }
       
      data <- data %>% 
        mutate(across(!!var_b, add, 1))
      
      return(data)
    }
    

    返回:

    add_one(df, col_of_interest, 999)
    
    # A tibble: 11 x 2
          id col_of_interest
       <dbl>           <dbl>
     1     1              22
     2     2              23
     3     3              24
     4     4              25
     5     5              26
     6     6              27
     7     7              28
     8     8              29
     9     9              30
    10    10              31
    11    11              NA
    

    首先,您需要使用 enquo() 函数引用感兴趣的变量,然后在您想要的位置取消引用此变量(使用 bang bang !!)。您的函数的另一个问题是在管道中间插入您的 if 语句,这不起作用。如果需要在特殊情况下应用某些方法,则需要与主计算分开评估。

    【讨论】:

    • 谢谢!在编写函数时,我关注了这个页面:(dplyr.tidyverse.org/articles/programming.html)。 “当您在函数参数中有数据变量(即包含 promise2 的 env 变量)时,您需要通过将其括在双括号中来包含参数,例如 filter(df, {{ var }})。”您介意解释一下为什么这里不是这种情况吗?
    • 嘿@Emman,我不确定这一点,但我认为花括号{} 用于引用表达式,而不是变量名本身。这不会导致任何问题,如果您尝试用{{ var }} 替换我的代码!!var_b,您会发现它也可以正常工作。只是使用enquo()!! 是更标准的方法。复制它?
    • 当然。但我现在明白我的问题也与使用更新的整洁评估方法有关。选项 A:我遇到了 tidy 评估的限制,这在我的情况下不起作用;这意味着我应该使用像你这样的更传统和更值得信赖的方法。选项 B:我没有正确使用 tidy 评估。
    • 不是新旧的问题,而是适合您的情况的 wright 应用程序是什么。 enquo()!! 通常用于从函数的参数中选择变量名。但是这种方法不起作用,例如,如果您想在across() 中选择所有数字列。在这种情况下,您需要使用花括号,通过将表达式 where(is.numeric) 传递给参数 var,在这样的函数行中:mutate(across({{ var }}))
    • 我想我用我的初始代码修复了它。我只是在else 部分中明确指定了drop_naxy 参数:na_if(x = ., y = {{ val_na_if }} )。它运行时根本不使用!!enquo()。所以它确实可以运行,但你还会认为这不是编写函数的正确方法吗?
    【解决方案2】:

    我通过简单地指定drop_naxy 参数解决了这个问题。

    add_one <- function(data, var, na_if_val = NULL) {
    
      data %>%
    
        mutate(across({{ var  }}, as.numeric)) %>%
        
        {if( is.null( {{ na_if_val }} )
        ) .  # <--- the dot means: "return the preexisting dataframe"
    
          else
    
            na_if(x = ., y = {{ na_if_val }} ) ## <-- change is here
    
        } %>%
        
        mutate(across({{ var  }}, add, 1))
    }
    
    
    add_one(data = df,
            var = col_of_interest,
            na_if_val = 999)
    
    ## # A tibble: 11 x 2
    ##       id col_of_interest
    ##    <dbl>           <dbl>
    ##  1     1              22
    ##  2     2              23
    ##  3     3              24
    ##  4     4              25
    ##  5     5              26
    ##  6     6              27
    ##  7     7              28
    ##  8     8              29
    ##  9     9              30
    ## 10    10              31
    ## 11    11              NA
    

    编辑

    根据@LionelHenry 的评论,我删除了na_if_val 周围的{{ }}

    add_one <- function(data, var, na_if_val = NULL) {
    
      data %>%
    
        mutate(across({{ var  }}, as.numeric)) %>%
    
        {if( is.null(na_if_val)
        ) .  # <--- the dot means: "return the preexisting dataframe"
    
          else
    
            na_if(x = ., y = na_if_val)
    
        } %>%
    
        mutate(across({{ var  }}, add, 1))
    }
    

    【讨论】:

    • 嗨@Emman。您应该只将!!{{ 与数据屏蔽函数一起使用。在这里,您将{{is.null()na_if() 一起使用,这是正常功能。这没有做任何事情。它之所以有效,是因为 na_if_val 也是一个正常参数。我建议只删除 na_if_val 引用周围的 {{,这样你的功能会更简单,更不容易混淆。
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