在 R 中运行 glmnet 包，得到错误“需要 TRUE/FALSE 的缺失值”，可能是由于缺失值？答案

【问题标题】：Running glmnet package in R, getting error "missing value where TRUE/FALSE needed", maybe due to missing values?在 R 中运行 glmnet 包，得到错误“需要 TRUE/FALSE 的缺失值”，可能是由于缺失值？
【发布时间】：2015-03-26 04:38:59
【问题描述】：

我正在尝试使用 glmnet 包中的 glmnet 来运行 LASSO 回归。

我正在使用以下命令：

library(glmnet)
glmnet(a,b,family="binomial",alpha=1)

我得到了错误：

> Error in if (!all(o)) { : missing value where TRUE/FALSE needed

a 是一个带有数值的矩阵。 b 是一个以因子为值的向量。

但是，b 有一些缺失值。我怀疑这可能是导致错误的原因。但是，我在 glmnet 文档中没有看到排除 NAs 的选项。

【问题讨论】：

能否在运行glmnet 后添加dput(a) 和dput(b) 以及traceback() 以帮助我们进行复制和诊断？
您尝试预测的课程中有 NA

标签： r glmnet

【解决方案1】：

由于glmnet 不接受带有公式的完整数据框（因此没有 na.omit），而是使用单独的响应矩阵和预测矩阵，因此您必须找出 b 中缺少哪些值，并且然后子集您的预测矩阵以排除这些行。

library(glmnet)

set.seed(123)
a <- matrix(rnorm(100*20),100,20)
b <- as.factor(sample(0:1,100,replace = TRUE))

b[10] <- NA

na_index <- is.na(b)
res <- glmnet(a[!na_index, ], b[!na_index], family = "binomial", alpha = 1)

【讨论】：