你能建议我一种在 R 中自动加载包的方法吗？我的意思是，我想在 R 中启动一个会话，而无需多次使用 library('package name')。假设我下载了下次启动 R 时要使用的所有包。
【问题讨论】：
.Rprofile/Rprofile.site 文件中定义一个 load_extra_packages() 函数来加载你想要的所有包（并打印出它们的名称），然后在开头运行该命令你的会话——这将使你的代码透明，即使不是完全独立的......
标签： r loading r-package r-faq defaults
将library(foo) 放入您的.Rprofile 文件或设置R_DEFAULT_PACKAGES：参见?Rprofile ...
尤其是（因为?Rprofile 很长而且可能令人生畏）：
如果您想要一组不同的软件包而不是默认软件包，当您 开始，在“.Rprofile”中插入对“options”的调用，或者 “Rprofile.site”文件。例如，'options(defaultPackages = character())' 将不会在启动时附加额外的包（只有 'base' 包）（或将'R_DEFAULT_PACKAGES=NULL' 设置为环境 运行 R) 之前的变量。使用‘options(defaultPackages = "")' 或 ‘R_DEFAULT_PACKAGES=""’ 强制执行 R system 默认值。
由于您可能确实希望加载所有默认包，然后添加额外的包（而不是说，不加载某些默认包），您可以放置
library("mypackage1")
library("mypackage2")
[etc.]
或使用options(defaultPackages=...):
options(defaultPackages=c(getOption("defaultPackages"),
"mypackage1","mypackage2", ... [etc.]))
在你的.Rprofile 中追加你想要的包到标准默认值。
edit（从评论中复制）重新在Rstudio 中工作：
http://rstudio.org/docs/using/workspaces 建议 Rstudio 执行 .Rprofile 然后“执行 R 启动 [http://stat.ethz.ch/R-manual/R-patched/library/base/html/Startup.html] 中描述的其他操作”（与 ?Rprofile 相同）。是否查看Rprofile.site 是模棱两可的。
edit #2：根据下面的评论，它确实适用于最新版本的 Rstudio。
【讨论】：
?Rprofile 很长并且可能令人生畏”。就是这样，也是一个非常紧凑的和完整的文档。绝对推荐阅读。
Rprofile.site 文件中添加这一行library(foo)，但我没有得到我想要的。 foo 是什么意思？那是什么？它应该是我要加载的确定包的名称吗？
foo 是一个老式的“占位符”变量。例如，您可以尝试library("ggplot2"); library("emdbook"); library("quantreg"); library("rms")（作为您可能想要包含的一些真实软件包的示例）。
有一个名为 .Rprofile 的文件，它只是一个脚本，每次启动新的 R 会话时都会运行。
您需要做的是添加library(package) 到它。如果您使用的是 Unix，它可能在您的主文件夹中作为隐藏文件。
【讨论】：
Quick-R page on customizing R startup 包含的信息与 Ben 和 Joao 的答案基本相同，但可能更清楚一些。在您的主文件夹（Windows 上的文档）中创建具有所需更改的 Rprofile.site 文件的副本，并将其命名为 .Rprofile
编辑：我注意到 R 3.0.0 不再从 Documents 文件夹中查找，而是在 Windows 7 下使用用户的主目录（用户名）。不过，这可能是一个安装问题（即我之前碰巧“错误地”安装了 R）。但是，此答案中链接的 Quick-R 页面告诉了这样做的正确方法。如果其他人遇到此问题，解决方法是将.Rprofile 复制到用户的主目录。
【讨论】：
快速的回答是你应该把你的 R 包放在.Rprofile 文件中，就像大家建议的那样。
但请注意，R 将读取此文件，然后加载 R 基础包。见?Startup：
请注意，当网站和用户配置文件的来源只有 基础包已加载，
如果您要加载的包增强/覆盖了某些 R 基本函数，这可能会导致问题。参见例如 tidyverse::filter: https://github.com/tidyverse/dplyr/issues/1611
到目前为止，我可以看到两种解决方案：
在.Rprofile 文件的第一行使用.First.sys()：这是通常在读取.Rprofile 后运行的命令，用于加载getOption("defaultPackages") 中的包。
更新选项defaultPackages：不要在.Rprofile 中使用library()，而是使用类似的东西。
old <- getOption("defaultPackages")
options(defaultPackages = c(old, "tidyverse"))
【讨论】：
plot vs sp::plot）。 .First.sys() 解决方案让我省了很多麻烦......谢谢！