使用 python3-config 进行 Pybind11 编译不起作用

Question

我想使用 Pybind11 将一个简单的 C++ 函数集成到 Python 中。 考虑以下虚拟函数的简单示例：

#include <vector>
#include <pybind11/pybind11.h>
#include <pybind11/stl.h>

namespace py = pybind11;

// Dummy function: return a vector of size n, filled with 1
std::vector<int> generate_vector(unsigned int n)
{
    std::vector<int> dummy_vector;
    for(int i = 0; i < n; i++) dummy_vector.push_back(1);
    return dummy_vector;
}

// Generate the python bindings for this C++ function
PYBIND11_PLUGIN(example) {
    py::module m("example", "Generate vector of size n");
    m.def("generate_vector", &generate_vector, "Function generates a vector of size n.");
    return m.ptr();
}

我将此代码存储在名为 example.cpp 的函数中 我将 Python 3.5.2 与 Anaconda 一起使用。关注official documentation， 我编译脚本如下：

c++ -O3 -shared -std=c++11 -I /Users/SECSCL/anaconda3/include/python3.5m `python-config --cflags --ldflags` example.cpp -o example.so

我不确切知道“python-config”部分代表什么，但我知道它会导致问题。我尝试了三个选项：

1. python-config：这会导致 clang 错误，链接器命令失败
2. python3-config：与 python-config 相同的问题

3. python3.4-config：这实际上有效并创建了一个 example.so 文件。但是当我尝试从 python3.5 加载它时，我得到了错误

   致命的 Python 错误：PyThreadState_Get：没有当前线程

总而言之，我的问题是：如何编译我的代码以便可以从 python3.5 加载它？或者更准确地说：我必须用什么来替换“python-config”语句？

Answer 1

我能够在 2015 年初的 macOS Sierra MacBook Pro 上运行您的示例。

我使用了您的example.cxx 代码，没有做任何更改。

在编译模块之前，必须确保anaconda环境处于活动状态，以便编译命令调用正确的python-config命令。

在我的例子中，这是通过 source ~/miniconda3/bin/activate 完成的——你显然必须将 miniconda3 替换为 anaconda3。

现在仔细检查您的编译命令是否会调用正确的python-config，方法是：which python3.5-config——这应该表明它正在使用您的 anaconda3 python3.5-config。

现在您可以按如下方式调用编译：

c++ -O3 -shared -std=c++11 -I $HOME/build/pybind11/include \
-I $HOME/miniconda3/include/python3.5m \
`python3.5m-config --cflags --libs` -L $HOME/miniconda3/lib/ \
 example.cpp -o example.so

请注意，我必须将包含路径添加到我的 pybind11 结帐中，指定确切的 python-config 版本 (3.5m)，将 --ldflags 更改为 --libs，以便 python-config 不会添加 --stack-size链接参数会导致错误，最后我为包含libpython3.5m.dylib的miniconda3（在你的情况下为anaconda）目录添加了-L

在这之后，我可以这样做：

$ python
Python 3.5.2 |Continuum Analytics, Inc.| (default, Jul  2 2016, 17:52:12)
[GCC 4.2.1 Compatible Apple LLVM 4.2 (clang-425.0.28)] on darwin
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import example
>>> v = example.generate_vector(64)
>>> print(v)
[1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1]

...非常整洁！