停止 slurm sbatch 将脚本复制到计算节点答案

【问题标题】：Stop slurm sbatch from copying script to compute node停止 slurm sbatch 将脚本复制到计算节点
【发布时间】：2014-08-26 12:46:57
【问题描述】：

有没有办法阻止 sbatch 将脚本复制到计算节点。例如当我运行时：

sbatch --mem=300 /shared_between_all_nodes/test.sh

test.sh 被复制到正在执行的计算节点上的 /var/lib/slurm-llnl/slurmd/etc/。问题在于 /shared_between_all_nodes/ 中还有 test.sh 需要使用的其他脚本，我想避免对路径进行硬编码。

在 sge 中，我可以使用 qsub -b y 阻止它将脚本复制到计算节点。 slurm 中是否有类似的选项或配置？

【问题讨论】：

标签： slurm

【解决方案1】：

使用 sbatch --wrap 是一个很好的解决方案

sbatch --wrap /shared_between_all_nodes/test.sh

如果脚本有参数，则需要引号

sbatch --wrap "/shared_between_all_nodes/test.sh param1 param2"

--换行= Sbatch 会将指定的命令字符串包装在一个简单的“sh”shell 脚本中，并将该脚本提交给 slurm 控制器。使用 --wrap 时，命令行中可能不指定脚本名称和参数；而是使用 sbatch 生成的包装脚本。

【讨论】：

【解决方案2】：

脚本可能会复制到那里，但工作目录将是启动sbatch 命令的目录。因此，如果该命令是从/shared_between_all_nodes/ 启动的，它应该可以工作。

要能够在任何地方启动sbatch 表单，请使用此选项

   -D, --workdir=<directory>
          Set the working directory of the batch script to directory before 
          it is executed.

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sbatch --mem=300 -D /shared_between_all_nodes /shared_between_all_nodes/test.sh

【讨论】：