使用 awk/bash 将 1 添加到所有列，但首先答案

【问题标题】：Use awk/bash to add 1 to all columns but first使用 awk/bash 将 1 添加到所有列，但首先
【发布时间】：2020-03-29 23:09:46
【问题描述】：

我有一个表格，其中标题是样本列表，第一列是基因列表，其余的是每个样本中每个基因的表达值。我想为所有值添加 1 的伪计数，我目前这样做：

cat <(head -n 1 TPM/QuickTest_Dataset.table) \
<(tail -n +2 TPM/QuickTest_Dataset.table | awk '{print $1, $2+1, $3+1, $4+1, $5+1, $6+1, $7+1, $8+1, $9+1, $10+1, $11+1, $12+1, $13+1, $14+1, $15+1, $16+1, $17+1, $18+1, $19+1, $20+1, $21+1}' | sed 's, ,\t,g') > StringTie-TPM_Homo_sapiens_GRCh38.Exp9-PMacrophageM1.protein_coding.table

但是，样本的数量并不总是 20（列的数量并不总是 21），有时更多有时更少，我每次都必须手动调整。

有没有更简单的方法？

【问题讨论】：

请在您的问题中添加示例输入（无描述、无图像、无链接）以及该示例输入所需的输出（无评论）。

标签： awk

【解决方案1】：

awk 是很棒的语言。只需遍历字段并递增它们。

awk '{ for (i = 2; i <= NR; ++i) $i += 1; } 1'

【讨论】：

【解决方案2】：

您可以通过一个awk 调用来做到这一点：

awk 'BEGIN{OFS="\t"} FNR==1{print; next} {for (i=2;i<=NF;i++)$i=$i+1}1' infile > outfile

【讨论】：

也可以在单个块中完成：FNR>1{for(i=2; i<=NF; i++) $i++} 1'
$i=$i+1 = $i+=1 或只是$i++。

【解决方案3】：

Google 搜索“awk 字段数”让我找到 this post，提到您可能使用的变量 NF。

搜索“awk for-loop”会重定向到this URL，其中演示了以下简单的awk for-loop（这也使用了NF 变量）：

awk '{ for (i = 1; i <= NF; i++) total = total+$i }; END { print total }'

这可能会为您解决此问题提供一个良好的开端。

【讨论】：