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一、软件安装

1、fastQC

conda install fastqc

若没有安装conda,则进行安装:

(1)https://bioconda.github.io

(2)然后点击Miniconda ,进入以下网站

         https://conda.io/miniconda.html

(3)选择相应版本软件,复制Linux 64-bit(bash installer)版本的网站

(4)进入interminal 终端,使用wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

(5)解压 unzip Linux-x86_64.sh

(6)进入解压目录

(7)

2、Trimmomatic软件

(1)进入网站:http://www.usadellab.org/cms/index.php?page=trimmomatic

(2)选中binary,按右键复制网址

(3)wget http://www.usadellab.org/cms/uploads/supplementary/Trimmomatic/Trimmomatic-0.36.zip

(4)解压文件:unzip Trimmomatic-0.36.zip

(5)进入解压目录:cd Trimmomatic-0.36

二、使用Trimmomatic过滤数据

 

三、使用FastQC进行质控

 

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