基于16s测序的微生物群落差异分析

https://www.sohu.com/a/214219431_278730

 

基于16s测序的差异分析无外乎就是物种差异，α 多样性差异以及β 多样性差异分析。最多，也就是基于PICRUSt，BUGBASE这类型的软件预测完功能后，再做一些功能差异分析。

 

常见的差异检验方法，可以分为两大类，一类是最基本的差异检验方法，只输出p值，例如t检验，秩和检验等。另外一类是可以输出p值的同时，也可以输出R值，如Anosim，Adonis等。下面来简单介绍一下这些方法。