RepeatMasker在运行时会先产生如下一个中间文件夹如RM_23346.WedAug301137422017,最后生成结果文件,例如.out,.masked,.tbl等

软件特性:软件运行很慢,而且很占内存(x100)。所以运行RepeatMasker时,要注意服务器的内存使用,内存超出会有can't fork错误。

建议:尽量将大文件切割成几M的小文件,合理搭配内存。做好时间预算。

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