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git 管理 Linux 文件系统有两个问题，第一个是 Linux 根文件系统的 root 权限问题，第二个就是git不上传空文件问题。
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一、 root权限问题的话就得在 root 用户下git , 只要 su 一下就行了。
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http://www.cnblogs.com/zengjfgit/p/6243817.html
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原理是将所有的空文件都加一个 .gitignore 文件
find . -name .git -prune -o -type d -empty -exec touch {}/.gitignore \;
find . -name .git -prune -o -type d -empty -exec touch {}/.emptyFolders \;