单细胞细胞注释 | MACA | singleR

单细胞常规分析里面有几个非常大的问题：

1. 到底聚出多少个类比较合适，参数如何选择，这个没有答案，建议从大往小，层级增加cluster的个数；
2. 确定了cluster后，如何注释？如果分析的细胞很少，那做实验的根据经验就能注释，但一旦cluster超过5个，注释就显得很难了（尤其是organoid，最少10个cluster，人为注释非常主观）；

 

可用工具：

MACA

singleR

 

 

参考：