实验室马上要开始做heart的单细胞空间转录组,需要提前了解一下基本的data。
废话不多说,先把示例数据和教程跑一遍,找找感觉。
参考:Seurat4.0系列教程22:空间转录组的分析、可视化与整合
样本制备 - 获取高质量数据的前提
参考:
- Visium Spatial Gene Expression - 10x Genomics
- NC|单细胞空间转录组学联合揭示鸡胚心脏发育过程 - 可以直接借鉴
- 单细胞文章也内卷?这篇38分的文章让你的单细胞与空间转录组数据锋芒毕露
- Nature综述:单细胞和空间转录组的数据整合
- Science | 完整胚胎规模的单细胞空间转录组学
- 10X Visium:空间转录组样本制备到数据分析