一、表型鉴定与记录的基本原则和原始数据处理
植物GWAS 全流程
1、各类性状的特点及鉴定与考察建议
当代形状或后代性状
2、表型的基本处理（第一步）
表型的基本处理
极端异常值的去除
异常值去除方法
多年多点表型处理
数据标准化
分类变量的哑变量赋值
3、表型的基本分析（第二步）
描述性统计分析
相关性分析
遗传力估计
这里是遗传方差
BLUP
二、标记的开发和分型
标记基因型的获得
比较
基因型填补
常见基因型填补软件
在水产里面基本不用，杂合较多。
测序深度的选择
水产就需要选择 10X
基因型过滤