分子生物学的“中心法则”通常将信使RNA(mRNA)作为蛋白质合成中携带信息的中间产物。近些年来,各种不编码蛋白的RNA(ncRNA)被发现,如microRNAs、lncRNA和CircRNA,其功能范围包括从表观遗传调控到转录调控和信号转导。因此,目前对RNA主要根据蛋白质编码能力分为mRNA和ncRNA。

然而,近年来的研究表明,许多以前注释为ncRNA的RNA具有蛋白质编码功能。例如,LncRNA LINC00961可编码一种名为SPAR的肽,它可以与溶酶体v-ATPase相互作用,负向调节mTORC1的**。另一方面,一些mRNA也被证明具有独立于其所编码蛋白质的非编码功能。例如,p53的mRNA可以与MDM2相互作用,阻断E3连接酶的活性,刺激p53 mRNA的翻译。这些研究证据表明,在某些情况下,某些mRNA可能能够发挥与ncRNAs类似的调控功能。

有鉴于此,研究人员将同时具有蛋白质编码和非编码功能的RNA被称为“cncRNA”。在某种意义上,cncRNA的发现模糊了“编码”和“非编码”RNA之间的界限,并促使研究人员重新考虑RNA的功能和进化。近年来,越来越多的cncRNAs被鉴定出来,包括可翻译的(translated)ncRNAs和可不被翻译(untranslated )的mRNAs,也有一些研究开始结合不同的高通量实验技术,如质谱、核糖体图谱和基于CRISPR的筛选来识别cncRNAs。

 

研究cncRNA的必备数据库,及使用方法

 

近日南方医科大学的Yang Zhang教授课题组在国际著名学术期刊《Nucleic acids research》发表了cncRNAdb数据库,该数据库记录了约2600条人工整理的cncRNA功能条目,并提供了实验证据,涉及20多个物种的2000多个RNA(包括1300多个可翻译的ncRNA和600多个翻译的mRNA)。

 

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