文献主要介绍PathAct Web tool 使用
PathAct 是一个Web工具，为User挺供图形化操作。User可以在信号通路上改变相应的基因表达量来模拟实验，并产生相应的报告。
PathAct提供针对选定基因的药物的信息，允许模拟它们的应用和剂量，并观察信号通路中的变化
总之，可以在pathway上，模拟基因的干预，药物的影响
使用及介绍
pathAct 使用KEGG上的数据，匿名用户等入不保存使用信息，注册用户可以保存。
操作界面：
A. Jobs : 上传data_matrix_expression_file(TSV格式)，文件中必须包含两行：
第一行是相应的基因，探针或蛋白质的ID
-
Ensembl gene
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HGNC symbol
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Entrez id
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Affy HG U133A probeset
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Affy HG U133B probeset
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Affy HG U133-PLUS-2 probeset
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Affy HTA 2.0
第二行是每个样本的基因表达值
exp：
或 
B.Pathway viewer panel C.通路列表 D.Activity value window：显示基因表达值
E.显示选中的基因，并可以修改对应表达的值 F.基因Search G.更新 H.显示pathway中的circuit I.药物搜索 J.显示药物对基因的影响
Setting里可以根据实际，配制每种药物的影响效果
生成的报告：
Input：列出已经修改的表达值
Circuit impact：通路名称和取对数的值 （log (Fold_Change)）
exp: 在设置中修改fold change为2，则绝对值大于log(2)=0.6931472为显著.
官方介绍：http://pathact.babelomics.org/doc/doku.php?id=workflow