cardiac

Medical Segmentation Decathlon(open)

Target: Left Atrium(心房) 

Modality: Mono-modal MRI  

Size: 30 3D volumes (20 Training + 10 Testing)

Source: King’s College London

Challenge: Small training dataset with large variability

HVSMR 2016

MICCAI子会议;3D心血管磁共振(CMR;1.5T)图像数据集上全心和大血管分割;其中:全心分类包括左,右心房,左,右心室,主动脉,肺静脉,肺动脉以及上​​腔静脉和下腔静脉。血管(除主动脉外)仅延伸至其起源之外几厘米,心肌类别包括围绕两个心室的粗壮肌肉以及它们之间的隔膜。冠状动脉不包括在血池类别中,如果它们在心室心肌内传播,则被标记为心肌;open

数据集:用于训练/测试的数据的三个选项:

(1)完整的轴向图像,即原始图像和标签(train dataset)

(2)裁剪的轴向图像和标签(train dataset)

(3)裁剪的图像已转换为近似的短轴视图(train dataset)

Cardiac MRI dataset(open)

数据集:来自33例被试,每例沿长轴包括20帧和8-15个切片,共7980张16bits Dicom in .mat。并进行了手动分割,其中左心室的心内膜和心外膜均可见,总共分割了5011个MR图像和10022个轮廓。


Else:

CoronARe(17)(few people follow)

MICCAI子会议;从X射线血管造影术进行冠状动脉重建;需申请

数据集:470M;XCAT模拟的数字幻像图像

带有选择性对比冠状动脉的整个胸部的投影图像(仅左侧支)

在200°和5 s内获得133个投影,960×960像素,各向同性像素尺寸为0.32 mm

80 bpm的心跳

数字减影血管造影(DSA)图像

一致的图像

不一致的不同程度(非零像素的10%,20%,30%)

以密集采样点列表形式的2D中心线

完美提取,即没有异常值

分割不完美,离群值有多个水平(中心线点的10%,20%,30%)

从3D世界到2D像素坐标的投影矩阵

完美的校准,即用于渲染投影的矩阵

Biomedical images dataset findings(3 cardiac page)

Lumen + External Elastic Laminae (Vessel Inner and Outer Wall) Border Detection(11)(few people follow)

血管内外壁边界检测;需email申请

数据集:训练集:将于2011年8月26日提供用于训练的第一组数据集,以及手动注释(占可用数据的25%)。

测试集:将于2011年8月26日提供第二组数据集。但是,注释将仅在研讨会当天发布。

验证集:将随机选择属于测试集的一小部分帧(约10个)。 该数据集将在挑战当天提供。

dataset attributes:

Biomedical images dataset findings(3 cardiac page)

The Right Ventricle Segmentation Challenge(12)

MICCAI子会议;右心室分割挑战;需注册申请

数据集:train valid test 各16例 说明文档 

注:数据集效果欠佳,可能有坑,like this

Biomedical images dataset findings(3 cardiac page)

Rotterdam Coronary Artery Algorithm Evaluation Framework

 

评估和比较用于心脏CT血管造影(CTA)的图像分析的不同算法;冠状动脉算法评估框架&冠状动脉狭窄的检测和定量评估框架;需注册申请;可供下载训练和测试集并进行软件评估,可递交算法结果。

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