基础研究中,药物、基因、蛋白、疾病都是一个一个散落点,把这些点串起来就是信号通路,我们所做的研究往往就是用我们的实验结果,在信号通路图上添上一笔。然而,信号通路图往往很复杂(如上图),怎么快速查找并直观了解,我推荐下面这个数据库给你。

Pathbank(信号通路银行)

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掌握这个数据库,轻松了解各个信号通路!

PathBank是一个交互式的可视化数据库,包含在模型生物(例如人类,小鼠,大肠杆菌,酵母和拟南芥)中发现的100,000多个信号通路。这其中的大多数在其他数据库中找不到,这也是这个数据库的优势所在。

所有信号通路中涉及的蛋白、代谢小分子、药物等都有详细地解释,并通过超链接的方式连接到专业数据库。

所有PathBank途径均附有详细的说明和参考,以概述每个图中描绘的途径,状况或过程。该数据库易于浏览,并支持全文,序列和化学结构搜索。

用户可以用代谢物名称,药物名称,基因/蛋白质复合物名称,SwissProt ID,GenBank ID,Affymetrix ID或安捷伦微阵列ID的列表查询PathBank。这些查询将生成匹配路径的列表,并在每个路径图上突出显示匹配分子。

基因,代谢物和蛋白质复合物浓度数据也可以通过PathBank的作图界面可视化。每个PathBank的图像,描述和表格都可以几种格式下载。

 

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