• 平时做一些项目,在样品不多的情况下,使用fastqc,可以对每个样品单独生成质控报告。然而,当遇到群体遗传相关的项目、样本数量比较多的时候,则需要统计所有样品生成汇总表,方便观察各样品质控结果。因此我们选择使用Multiqc来对结果进行汇总。
  • 使用软件:Multiqc
  • 安装说明:
    • conda: conda install -c bioconda multiqc
      • 目前其他博客提到的使用conda的方式我这里没有成功,大家也可以试试
  • 使用说明:
    • multiqc /home/project/fastqc_result -o home/project/multiqc_result
  • 结果展示
    • 2020.11.18丨Multiqc使用对多样本数据进行统计2020.11.18丨Multiqc使用对多样本数据进行统计
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