基本上都通过 Window -> Preferences 进行设置：
Java 保存自动格式化：
Java：Java -> Editor -> Save Actions，选中 Perform the selected actions on save，选中 Format source code；
JavaScript 格式化：MyEclipse -> Files and Editors -> JavaScript -> Editor -> Save Actions，操作同上。
XML 格式化：
General -> MyEclipse -> XML -> XML Files -> XML Source -> Split multiple attributes each on a new line。
代码自动提示：
Java -> Editor -> Content Assist，将 Auto activation triggers for Java 的值由 “.” 更改为 “.abcdefghijklmnopqrstuvwxyzABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ”。
单行注释不换行（非更改行长度），保持注释前格式：
Java -> Code Style -> Formatter，Edit（如果没有新建的话请先新建），Comments 选项卡，将 Enable line comment formatting 取消勾选即可。
PS：<pre> …… </pre> 是在 /** …… */ 中保持格式不改变。
代码格式的缩进为空格：
Java -> Code Style -> Formatter，Edit（如果没有新建的话请先新建），Indentation 选项卡，将 Tab policy 更改为 Spaces only，Indetation size 的话看喜好。
制表符更改换空格：
General -> Editors -> Text Editors，勾选 Insert sapces for tabs， Displayed tab width 的话看喜好。
将默认 JRE 替换为自定义的：
Java -> Installed JREs，点击 Add 按钮，选中 Standard VM，点击 Next 按钮，点击 Directory… 按钮，选择 JDK 目录。
然后勾选刚添加的 JRE，将它作为默认的。
修改 JSP 文件默认编码：
MyEclipse -> Files and Editors -> JSP，将 Encoding 更改为 ISO 10646/Unicode(UTF-8)。
关闭 Maven 自动更新：
Maven：MyEclipse -> Maven[4MyEclipse]，去除勾选 Download repository index updates on startup。
取消文件自动校验：
Myeclipse -> Validation，Build 一列，只保留 Classpath Dependency Validator，其它全部去掉。
手工验证方法：在需要验证的文件上，鼠标右键，MyEclipse -> Run Validation。
设置工作空间项目编码（创建在工作空间的项目编码自动为 UTF-8）：
General -> Workspace，Text file encoding 更改为 Other UTF-8[，New text file line delimiter 更改为 Other Unix]，Next text file line delimiter 更改为 Other Unix。
更改 JSP 默认编辑器：
General -> Editors -> File Associations，File types 中找到 *.jsp，Association editors 中将 MyEclipse JSP Editor 设置为 Default。
取消启动和关闭时加载的模块：
General -> Startup and Shutdown，取消勾选一些不用的模块，模块作用暂略。
关闭启动 Service 后自动跳转回 Service 窗口：