GATK软件介绍

• 背景介绍

GATK全称是The Genome Analysis Toolkit，是Broad Institute（The Broad Institute, formerly the Broad Institute of MIT and Harvard, evolved from a decade of research collaborations among MIT and Harvard scientists.）开发的用于二代重测序数据分析的一款软件，里面包含了很多有用的工具，主要注重与变异的查找，基因分型且对于数据质量保证高度重视。

• 主要原理

• 使用方法：参考http://www.plob.org/2014/04/19/7005.html（内容很详细，不做重复介绍）