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2018 T-MI (IEEE Transactions on Medical Imaging )
Disc-Aware Ensemble Network for Glaucoma Screening From Fundus Image

Method : 分类 (混合了分割模型)
Dataset :ORIGA、SCES 、SINDI 5783(5670N,113G)
Architecture : DENet(4个流)
Results : SCES AUC 0.9183 SE 0.8429 SP 0.8380
SINDI AUC 0.8173 SE 0.7876 SP 0.7115

整合了全局眼底图像和局部视盘区域的深层次背景

Methods

大多数现有的自动筛选方法首先对主要结构进行分割,然后计算用于检测和筛查青光眼的临床测量。然而,这些基于测量的方法严重依赖于分割准确性并忽略各种视觉特征。

不同level和model上的四个深度流分别被视为全局图像流,分割网络,视盘区域流和视盘极化转换流。最后,融合不同流的输出概率作为最终筛选结果。

DENet特点

  • Disc-aware
    突出视盘区域中的上下文信息。
  • Multi-level
    结合 globel image 和 optic disk region
  • multi-model
    分类、分割、几何变换

Pipeline

【医学+深度论文:F15】2018 Disc-Aware Ensemble Network for Glaucoma Screening From Fundus Image
  • Global Fundus image level

    • 数据增强:随机旋转(0/90/180/270度)和随机翻转

    • Global image stream
      全局眼底图像的分类

      • 输入:224×224
      • pre-trained ResNet50
      • BCE loss
    • Segmentation-guided network
      全局眼底图像 视盘分割 图像级别分类

      • 输入:640 ×640
      • Unet
      • 扩展了新分支 + 2FC 二分类
      • Dice coefficient loss
  • Optic Disc region level

    • 数据增强 : 随机旋转(0/90/180/270度),裁剪漂移(±20像素)和随机翻转来完成

    • Disc region
      局部视盘图像 分类

      • 输入:224×224
      • pre-trained ResNet50
      • BCE loss
    • Disc region with polar transformation
      局部视盘图像 分类
      杯状区域的比例比原始眼底图像中的比例增加并且更平衡

      • 输入:224×224
      • pre-trained ResNet50
      • BCE loss

Dataset

  • ALL

resolution : 3072× 2048
cropped disc region :800 × 800

  • Training set

ORIGA 650(168G、482N)
manually labelled ground truth of optic disc boundary

使用 ORIGA 做 disc segmentation 和glaucoma screening

  • Test
    SCES 1676 (46G,1630N)
    SINDI 5783(5670N,113G)

【医学+深度论文:F15】2018 Disc-Aware Ensemble Network for Glaucoma Screening From Fundus Image

Results

  • 实验流分析:全局图像分类比分割网络分类结果更好,作者想原因可能是因为全局图像分类网络 使用了预训练的 resnet50 ; 使用4个流>3个流>2个流

  • 实验经验:我们不使用加权和来对流进行整合,因为平均操作是一种简单而有效的方法,没有任何先验信息。

  • 训练完后,测试/每张图片 运行时间快

  • 高灵敏度

Discussion

  • 集合深度网络,灵活 , 容易适应不同的场景。

  • 通过光盘分割来定位青光眼区域来做分类

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