出现了好几次这个问题，每次解决之后，每次都会忘记怎么解决的，下定决心要把它解决办法写下来。
双击services, 找到Server Options 点击"Public module contexts to separate XML files" 跟我图中一样即可，就可以解决这个问题，如果解决不了我建议你移除项目再重现加入，就可以解决。下面还有另一种根本上解决的方法。
第二种方法：
找到这个Servers这个项目打开，点开conrext.xml，
默认情况下，server.xml的 Context元素不支持名称为source的属性，所以会发出警告。
之后把source="org.eclipse.jst.jee.server:"的内容去掉保存即可。