cBioPortal数据库是探索肿瘤的基因组学特征，是从DNA水平进行的，是对机制的进一步研究。基因差异表达、生存分析和免疫浸润分析，上述分析严格意义上讲均属于表型。免疫浸润分析属于交叉，算是表型式的解释，就是用现象解释现象，但其实并没有涉及具体的机制。
TCGA数据中除包括样本的表达信息、生存分析信息，也包括突变、拷贝数、甲基化以及临床信息等数据，因此可用于多组学的交叉分析。今天，我们分享TCGA多组学分析的神器，肿瘤基因组学分析的神器——cBioPortal，不需要注册，登录即可免费使用：
cBioPortal（见文末）
cBioPortal网站目前存储DNA拷贝数数据（每个基因的假定，离散值，例如“深度缺失”或“扩增”，以及log2水平），mRNA和microRNA表达数据，非同义突变，蛋白质水平和磷蛋白水平（RPPA）数据，DNA甲基化数据和有限的临床数据等，可以快速获取大规模癌症基因组学项目的分子谱和临床预后相关性，并将这些丰富的数据集转化为可视化数据以用于临床。