Dwzb , R语言中文社区专栏作者,厦门大学统计专业学生。
知乎专栏:https://zhuanlan.zhihu.com/Data-AnalysisR
前文推送:
由于merge数据在现实应用中使用非常广泛,而且真实的数据远远没有我们练习时使用的数据那么干净,所以有了这篇文章。本文会针对现实数据中可能遇到的一些问题,更深入地讲解merge数据的使用。
数据:自己有针对性地创建,故意踩一些坑并解决
函数:包括dplyr包的join族函数,data.table包的[DT, ]方法,基础及data.table包的merge函数
主要解决如下问题
要合并的两个数据集,合并所依据的列,名称不同
要合并的两个数据集,有一些相同的列名,合并后需要更改防止两列同名
合并所依据的列不是完全相同的,展示多种取舍方法
合并所依据的列中,内容不是唯一的,展示几种情况的处理方法
全文分dplyr包和data.table包来讲
数据创建
先简单说明一下创建的数据
第一组一共四个数据框
data_map 有两列可以用于merge,作为其他数据之间的桥梁,将所有数据merge在一起
data_good 用于merge的列形式很好,和data_map中的列一一对应,用于展示最简单的数据框merge合并。但是为了演示一些参数,在列名上挖了两个坑
data_diff 用于merge的列和data_map中的列有交集,都不完全包括对方,用于展示多种取舍方法在两个包中的 实现
data_bad 用于merge的列有重复,与data_map这个没有重复的数据来merge
第二组两个数据框: bad1和bad2,用于merge的列都有重复,用于展示都有重复时的merge
这里主要展示数据框创建代码,数据框长什么样子,在下面的例子中都会展示
library(dplyr)
library(data.table)
library(lubridate)
# 设置随机种子保证随机试验可以重复
set.seed(1234)
# 两列每个值都是唯一的
data_map <- data.table(name_id = letters[1:10], card_id = LETTERS[1:10])
m2 <- sample(letters[1:10], 15, replace = T)
m1 <- sample(LETTERS[1:10], 10, replace = F)
# object_id列值是唯一的,且正好和data_map的name_id列一一对应
data_good <- data.table(object_id = m1, # 与card_id列对应来合并,故意制造合并列名称不同的情况
name_id = paste(m1, m1, sep='')) # 故意制造同名情况
# name_id列值唯一,与data_map的name_id只有4个重合的
data_diff <- data.table(name_id = sample(letters, 10, replace = F),
x1 = c(rep('m',4), rep('n',3), rep('p',3)))
# name_id列值不唯一,与data_map的name_id只有7个重合的,但是data_bad中有的在data_map中都能找到
data_bad <- data.table(name_id = m2, # 与name_id对应来合并
date = ymd('20171218') + ddays(rowid(m2)),
content1 = paste(m2, 1:15, sep='_content'),
content2 = paste(m2, 1:15, sep='another'))
bad1 <- data.table(name_id = c(1,2,3,1,4,5,1,6),
text1 = letters[1:8])
bad2 <- data.table(name_id = c(1,2,3,1,2,5,3,7),
text12 = LETTERS[1:8])
join族函数
dplyr包中,join族函数分为如下几个函数(对于 *_join(new, data_diff, by='name_id') 来说)
left_join 以new中name_id(记为A)为准。data_diff的name_id中,不在A中的全部舍弃,其余的对应匹配上去
right_join 和left相反,以data_diff为准
inner_join 保留两个数据name_id交叉的部分
full_join 两个数据所有内容都保留,相当于left_join结果,加上right_join结果,减去inner_join的结果
semi_join 与 anti_join 其实是对行筛选,不算是merge合并
下面代码结果分别展示
1. 这部分展示
join族函数中的两个参数 by suffix
各个join函数有什么区别
代码展示如下
new <- left_join(data_map, data_good, # 这是两个完全匹配的数据
by = c('card_id'='object_id'), # 对应匹配的列名不同,在此指定
suffix = c('', '_good')) # 两个数据有相同列名,指定融合后,两个数据集相同列名,分别加什么样的后缀
head(new)
left_join(new, data_diff, by = 'name_id')
right_join(new, data_diff, by = 'name_id')
left_join(data_diff, new, by = 'name_id') # 除了列顺序之外,内容和上一条是一样的
inner_join(new, data_diff, by = 'name_id')
full_join(new, data_diff, by = 'name_id')
semi_join(new, data_diff, by = 'name_id')
new[new$name_id %in% data_diff$name_id, ] # 同上
anti_join(new, data_diff, by = 'name_id')
new[!new$name_id %in% data_diff$name_id, ] # 同上
结果展示如下
首先合并的是data_map和data_good得到new
data_map data_good
name_id card_id || object_id name_id
a A || I II
b B || C CC
c C || J JJ
d D || B BB
e E || G GG
f F || F FF
g G || E EE
h H || A AA
i I || H HH
j J || D DD
new
card_id name_id name_id_good
A a AA
B b BB
C c CC
D d DD
E e EE
F f FF
G g GG
H h HH
I i II
J j JJ
下一步是new和data_diff的多种合并结果
new (name_id只有4个重合) data_diff
name_id card_id name_id_good || name_id x1
a A AA || v m
b B BB || n m
c C CC || z m
d D DD || t m
e E EE || b n
f F FF || j n
g G GG || f n
h H HH || w p
i I II || u p
j J JJ || d p
left_join(保留new)
name_id card_id name_id_good x1
a A AA <NA>
b B BB n
c C CC <NA>
d D DD p
e E EE <NA>
f F FF n
g G GG <NA>
h H HH <NA>
i I II <NA>
j J JJ n
right_join(保留data_diff)
name_id card_id name_id_good x1
v <NA> <NA> m
n <NA> <NA> m
z <NA> <NA> m
t <NA> <NA> m
b B BB n
j J JJ n
f F FF n
w <NA> <NA> p
u <NA> <NA> p
d D DD p
inner_join(取交集)
name_id card_id name_id_good x1
b B BB n
d D DD p
f F FF n
j J JJ n
full_join(取并集)
name_id card_id name_id_good x1
a A AA <NA>
b B BB n
c C CC <NA>
d D DD p
e E EE <NA>
f F FF n
g G GG <NA>
h H HH <NA>
i I II <NA>
j J JJ n
v <NA> <NA> m
n <NA> <NA> m
z <NA> <NA> m
t <NA> <NA> m
w <NA> <NA> p
u <NA> <NA> p
semi_join(在new中筛选出data_diff有的)
name_id card_id name_id_good
b B BB
d D DD
f F FF
j J JJ
anti_join(在new中筛选出data_diff没有的)
name_id card_id name_id_good
a A AA
c C CC
e E EE
g G GG
h H HH
i I II
2.接下来考虑一个数据merge列有重复的情况
# 只有一个数据的name_id有重复,就会自动扩充
left_join(new, data_bad, by = 'name_id')
right_join(new, data_bad, by = 'name_id')
结果展示如下
new
name_id card_id name_id_good
a A AA
b B BB
c C CC
d D DD
e E EE
f F FF
g G GG
h H HH
i I II
j J JJ
data_bad
name_id date content1 content2
b 2017-12-19 b_content1 banother1
g 2017-12-19 g_content2 ganother2
g 2017-12-20 g_content3 ganother3
g 2017-12-21 g_content4 ganother4
i 2017-12-19 i_content5 ianother5
g 2017-12-22 g_content6 ganother6
a 2017-12-19 a_content7 aanother7
c 2017-12-19 c_content8 canother8
g 2017-12-23 g_content9 ganother9
f 2017-12-19 f_content10 fanother10
g 2017-12-24 g_content11 ganother11
f 2017-12-20 f_content12 fanother12
c 2017-12-20 c_content13 canother13
j 2017-12-19 j_content14 janother14
c 2017-12-21 c_content15 canother15
left_join(new, data_bad, by = 'name_id')
name_id card_id name_id_good date content1 content2
a A AA 2017-12-19 a_content7 aanother7
b B BB 2017-12-19 b_content1 banother1
c C CC 2017-12-19 c_content8 canother8
c C CC 2017-12-20 c_content13 canother13
c C CC 2017-12-21 c_content15 canother15
d D DD <NA> <NA> <NA>
e E EE <NA> <NA> <NA>
f F FF 2017-12-19 f_content10 fanother10
f F FF 2017-12-20 f_content12 fanother12
g G GG 2017-12-19 g_content2 ganother2
g G GG 2017-12-20 g_content3 ganother3
g G GG 2017-12-21 g_content4 ganother4
g G GG 2017-12-22 g_content6 ganother6
g G GG 2017-12-23 g_content9 ganother9
g G GG 2017-12-24 g_content11 ganother11
h H HH <NA> <NA> <NA>
i I II 2017-12-19 i_content5 ianother5
j J JJ 2017-12-19 j_content14 janother14
right_join(new, data_bad, by = 'name_id')
name_id card_id name_id_good date content1 content2
b B BB 2017-12-19 b_content1 banother1
g G GG 2017-12-19 g_content2 ganother2
g G GG 2017-12-20 g_content3 ganother3
g G GG 2017-12-21 g_content4 ganother4
i I II 2017-12-19 i_content5 ianother5
g G GG 2017-12-22 g_content6 ganother6
a A AA 2017-12-19 a_content7 aanother7
c C CC 2017-12-19 c_content8 canother8
g G GG 2017-12-23 g_content9 ganother9
f F FF 2017-12-19 f_content10 fanother10
g G GG 2017-12-24 g_content11 ganother11
f F FF 2017-12-20 f_content12 fanother12
c C CC 2017-12-20 c_content13 canother13
j J JJ 2017-12-19 j_content14 janother14
c C CC 2017-12-21 c_content15 canother15
当我们要把多张表merge到一起时,如果有几张都是merge列有重复的情况,就会面临要merge的两个数据都是有重复的的情况
3.两个数据集merge列都有重复
代码展示如下(直接使用left_join看默认情况即可)
> bad1
name_id text1
1: 1 a
2: 2 b
3: 3 c
4: 1 d
5: 4 e
6: 5 f
7: 1 g
8: 6 h
> bad2
name_id text12
1: 1 A
2: 2 B
3: 3 C
4: 1 D
5: 2 E
6: 5 F
7: 3 G
8: 7 H
> left_join(bad1, bad2, by = 'name_id')
name_id text1 text12
1 1 a A
2 1 a D
3 2 b B
4 2 b E
5 3 c C
6 3 c G
7 1 d A
8 1 d D
9 4 e <NA>
10 5 f F
11 1 g A
12 1 g D
13 6 h <NA>
从上面结果可见,比如1重复,则bad1中的每个1都和bad2的每个1构成一行,所以产生了3*2=6个name_id是1的行。
这样merge有一个缺点就是产生了大量重复数据,还有另一种处理方法,长表变宽表,这样可以让name_id不会重复,但是列就会增加很多。
这里只展示data_bad如何将name_id唯一化的,即把date变到列上去,即看每个name_id在各个date上的content1和content2分别是什么
> data_bad
name_id date content1 content2
1: b 2017-12-19 b_content1 banother1
2: g 2017-12-19 g_content2 ganother2
3: g 2017-12-20 g_content3 ganother3
4: g 2017-12-21 g_content4 ganother4
5: i 2017-12-19 i_content5 ianother5
6: g 2017-12-22 g_content6 ganother6
7: a 2017-12-19 a_content7 aanother7
8: c 2017-12-19 c_content8 canother8
9: g 2017-12-23 g_content9 ganother9
10: f 2017-12-19 f_content10 fanother10
11: g 2017-12-24 g_content11 ganother11
12: f 2017-12-20 f_content12 fanother12
13: c 2017-12-20 c_content13 canother13
14: j 2017-12-19 j_content14 janother14
15: c 2017-12-21 c_content15 canother15
> data_bad %>% melt(id = c('name_id', 'date')) %>%
+ dcast(name_id~date+variable)
name_id 2017-12-19_content1 2017-12-19_content2 2017-12-20_content1 2017-12-20_content2
1: a a_content7 aanother7 NA NA
2: b b_content1 banother1 NA NA
3: c c_content8 canother8 c_content13 canother13
4: f f_content10 fanother10 f_content12 fanother12
5: g g_content2 ganother2 g_content3 ganother3
6: i i_content5 ianother5 NA NA
7: j j_content14 janother14 NA NA
2017-12-21_content1 2017-12-21_content2 2017-12-22_content1 2017-12-22_content2
1: NA NA NA NA
2: NA NA NA NA
3: c_content15 canother15 NA NA
4: NA NA NA NA
5: g_content4 ganother4 g_content6 ganother6
6: NA NA NA NA
7: NA NA NA NA
2017-12-23_content1 2017-12-23_content2 2017-12-24_content1 2017-12-24_content2
1: NA NA NA NA
2: NA NA NA NA
3: NA NA NA NA
4: NA NA NA NA
5: g_content9 ganother9 g_content11 ganother11
6: NA NA NA NA
7: NA NA NA NA
这样name_id唯一再merge到data_map表中,不会增加太多重复的行,但是这个方法也有一个很大的弊端,就是增加了太多列,产生了非常多的缺失值。
其实这种name_id不唯一的表,称为动态表;而唯一的是静态表
静态表表示这个id的静态数据,特征等,一个id就对应该指标的一个值
动态表则反映这个id的动态情况,比如哪一天这个id发生了什么,换一天又发生了什么,这样一个表就会出现多次同一个id,即name_id列有重复的内容
真正遇到这种问题时,其实没有必要非要把静态表和动态表合并在一起了,合并后数据格式都不好了,肯定也没办法分析
data.table
使用data.table运行结果和join族函数一样,所以这里只列代码
使用[]来合并,[]的在merge上的功能比较弱,而且别扭,只能做下面这些事
new <- data_map[data_good, on="card_id==object_id"]
new
# data_map[data_good, name_id_good:= i.name_id,on="card_id==object_id"][] # 要改名就在原数据上修改,改名没有join族函数方便
# 以data_diff为准
new[data_diff, on='name_id']
# 以new为准
data_diff[new, on='name_id']
但是[]中使用merge可以结合[]中其他位置的参数一起使用,在只需要简单merge时,可以达到多步合并为一行的简洁效果。
下面我们来看一下merge函数,data.table中的merge会比基础包中merge更快,同时更改了一些默认选项,基本使用以及参数都没有改变,这里的数据因为创建时使用的是data.table函数,所以使用merge时自动用的是data.table包中的函数
new <- merge(data_map, data_good, by.x='card_id', by.y='object_id', suffixes=c('','.good'))
new
# 全部保留
merge(new, data_diff, by='name_id', all=T)
# 保留new的
merge(new, data_diff, by='name_id', all.x=T)
# 保留data_diff的
merge(new, data_diff, by='name_id', all.y=T)
# 保留交集
merge(new, data_diff, by='name_id', all=F)
merge(new, data_bad, by='name_id', all.x=T)
merge(new, data_bad, by='name_id', all.y=T)
merge(bad1,bad2, by='name_id', all.x=T)
大家都在看
公众号后台回复关键字即可学习
回复 爬虫 爬虫三大案例实战
回复 Python 1小时破冰入门回复 数据挖掘 R语言入门及数据挖掘
回复 人工智能 三个月入门人工智能
回复 数据分析师 数据分析师成长之路
回复 机器学习 机器学习的商业应用
回复 数据科学 数据科学实战
回复 常用算法 常用数据挖掘算法