Rmd 中的“尚不支持长向量”错误，但 R 脚本中没有答案

【问题标题】："long vectors not supported yet" error in Rmd but not in R ScriptRmd 中的“尚不支持长向量”错误，但 R 脚本中没有
【发布时间】：2017-01-17 22:12:03
【问题描述】：

我正在使用 R 3.1 和 RStudio 0.99 操作矩阵。

我有我的 R 脚本，使用 cmd+enter 可以正常工作。

我创建了一个 Rmd 用于报告，但出现此错误

Error in lazyLoadDBinsertVariable(vars[i], from, datafile, ascii, compress,  : 
  long vectors not supported yet: ../../../../R-3.3.1/src/main/connections.c:5600
Calls: <Anonymous> ... <Anonymous> -> <Anonymous> -> lazyLoadDBinsertVariable
Execution halted

有没有办法绕过这个错误？

这似乎是Large Matrices in R: long vectors not supported yet的复制品

但不同的是，这仅在尝试创建 Rmd 时发生，在任何其他情况下都不会发生

【问题讨论】：

你正在处理多少个观察？
Large Matrices in R: long vectors not supported yet的可能重复
它是一个 28630x50247 矩阵，但错误只出现在 Rmd 中
另请查看：github.com/yihui/knitr/issues/572

标签： r rstudio knitr r-markdown

【解决方案1】：

我今天也遇到了这个问题，并通过在我的 .Rmd 的设置块中使用 cache.lazy = FALSE 来修复它。

所以我的 R Markdown 文件中第一个块的内容如下所示：

library(knitr)
knitr::opts_chunk$set(cache = TRUE, warning = FALSE, 
                      message = FALSE, cache.lazy = FALSE)

【讨论】：

这是正确的答案。我只是想添加它，无论出于何种原因，我都必须从options 而不是opts_chunk$set 访问它。所以我有options(cache = TRUE, warning = FALSE, message = FALSE, cache.lazy = FALSE)。如果这有什么不同，我在 RStudio 3.2.2 上
如果你正在缓存一个非常大的 R 对象，这可能是个问题。那是我的问题。
使用 knitr::opts_chunk$set 的原始答案在 R 3.5.1 上为我工作。
更多背景请阅读bookdown.org/yihui/rmarkdown-cookbook/cache-lazy.html

【解决方案2】：

我在尝试将 .rmd 文件编织成 pdf 时遇到了同样的错误。被指控的代码块被缓存。

有没有办法绕过这个错误？

删除 'cache = TRUE' 或将其设置为 FALSE 似乎可以解决问题。

【讨论】：

这并没有提供问题的答案。一旦你有足够的reputation，你就可以comment on any post；相反，provide answers that don't require clarification from the asker。 - From Review
嗨。我没有缓存。我现在缓存了，不管有没有缓存都会发生。已经评论了一个可能的解决方案。
感谢@etienne 的澄清。我不明白为什么我被否决了，因为我建议的解决方案实际上解决了我的脚本的问题。