【问题标题】:How to use XArray to merge specific netcdf4如何使用 XArray 合并特定的 netcdf4
【发布时间】:2020-01-29 08:29:41
【问题描述】:

背景

我有 2 年的 netcdf4 文件(每天 1 个 netcdf4 文件)。我一直在使用 X-Array 来合并文件,使它们易于使用。所有 netcdf4 文件都遵循相同的命名约定“YYYYMMDD_data_Nx.nc4.nc”

问题

但是,如果我只想使用我的数据子集的一个子集,例如 2019 年 1 月 1 日到 2019 年 1 月 31 日之间的文件,我该怎么办。

我目前拥有的东西

import xarray as xr

ds = xr.open_dataset('C:\\Users\\FILES\\*.nc')
df = ds
df.to_csv('export.csv', index=True)

【问题讨论】:

    标签: python merge python-xarray netcdf4


    【解决方案1】:

    解决了

    我查看了 xarray readthedocs 页面,在 open_mfdataset 页面中看到了这个简介。

    paths (str or sequence) – 格式中的字符串 glob “path/to/my/files/*.nc”或要打开的文件的明确列表。路径 可以作为字符串或 pathlib 路径给出。如果串联 需要多个维度,则路径必须是嵌套的 列表列表(有关详细信息,请参阅 manual_combine)。 (字符串 glob 将是 展开为一维列表。)

    因此我通过了一个列表

    更新和工作代码

    import xarray as xr
    from datetime import timedelta, date, datetime
    import pandas as pd
    import numpy as np
    
    
    # **************
    # Date Ranges
    # **************
    def daterange(start_date, end_date):
        for n in range(int((end_date - start_date).days)):
            yield start_date + timedelta(n)
    
    
    # Start & End Date
    start_date = date(2019, 1, 1)
    end_date = date(2019, 1, 31)
    
    # Empty List
    filepath = 'C:\\Users\\USER\\FILES\\'
    filelist = []
    
    # Loop through all MERRA2 files and add the ones we need to the list
    for single_date in daterange(start_date, end_date):
        YYYY = single_date.strftime("%Y")
        MM = single_date.strftime("%m")
        DD = single_date.strftime("%d")
        filename = filepath + YYYY + MM + DD + '_data_Nx.nc'
    
        filelist.append(filename)
    
    # Merge via X-Array and export to csv
    ds = xr.open_mfdataset(filelist, combine='by_coords')
    df = ds.to_dataframe()
    df.to_csv('export.csv', index=True)
    

    【讨论】:

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