通过 pubmed api 发布的类似 pubmed 文章答案

【问题标题】：similar pubmed articles via pubmed api通过 pubmed api 发布的类似 pubmed 文章
【发布时间】：2016-06-30 16:51:56
【问题描述】：

给定 pmid 是否可以获得类似的 pubmed 文章。这个link 的例子在右边显示了类似的文章。

【问题讨论】：

标签： pubmed

【解决方案1】：

您可以使用 NCBI API 使用 BioPython 来完成此操作。您要查找的命令是neighbor_score。或者，您可以直接通过URL 获取数据。

from Bio import Entrez

Entrez.email = "Your.Name.Here@example.org"
handle = Entrez.elink(db="pubmed", id="26998445", cmd="neighbor_score", rettype="xml")
records = Entrez.read(handle)

scores = sorted(records[0]['LinkSetDb'][0]['Link'], key=lambda k: int(k['Score']))
#show the top 5 results
for i in range(1, 6):
    handle = Entrez.efetch(db="pubmed", id=scores[-i]['Id'], rettype="xml")
    record = Entrez.read(handle)
    print(record)

【讨论】：

谢谢，我去看看。
你知道如何解读乐谱吗？
不幸的是，我将它们视为仅在整个列表的上下文中才有意义的任意数字。或许你可以在原文某处找到真正的含义：ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2212667