从 Gene Symbol 和 Vice Versa 获取 SwissProt ID

【问题标题】：Getting a SwissProt ID from Gene Symbol and Vice Versa从 Gene Symbol 和 Vice Versa 获取 SwissProt ID
【发布时间】：2016-11-09 19:17:58
【问题描述】：

我是 Bioconductor 的新手，我正在努力寻找能够做我想做的事情的合适的包。这就是给我一个 SwissProt ID 并给我基因符号，反之亦然。

有很多包，不知道要哪一个，有人能快速解答吗？

【问题讨论】：

标签： r bioconductor

【解决方案1】：

您可以采取的一种方法是使用以下有机体包：

library(org.Hs.eg.db)

假设我的基因符号就像这里的键中的那些：

keys <- c("A1BG","A2M","A2MP1","NAT1","NAT2","AACP")

然后您可以只使用 select() 方法（这适用于 R-2.14 及更高版本）。

select(org.Hs.eg.db, cols=c("SYMBOL", "UNIPROT"), keys= keys, keytype="SYMBOL")

希望这会有所帮助！

【讨论】：