【发布时间】：2018-06-27 23:08:13
【问题描述】：
代码是这样的：
gset <- ReadAffy()
pData(gset)
b1<-log2(exprs(gset))
boxplot(b1, col = 2:4)
str(exprs(gset))
List of 1
$ : symbol gset
在第三行，我收到此错误“log2(exprs(gset)) 中的错误：数学函数的非数字参数”。
几天前我使用相同的代码和相同的数据没有任何问题，但现在我不知道出了什么问题。我没有改变任何东西。
【问题讨论】：
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expres(gset)必须是数字才能应用log2()函数。写class(exprs(gset))时返回什么？ -
如果没有可重现的示例，几乎不可能调试它（这很难，因为 Affymetrix 数据集很大）。
str(exprs(gset))会很有用。 -
返回列表。我上周使用它，我没有问题。我不明白发生了什么变化。
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我们也不知道发生了什么变化，但可以保证 某事 发生了变化 - 无论是您的数据，还是这些数据都不是确切相同的命令，或者（不太可能）您已经更新了软件包并且它的工作方式不同。您能否编辑您的问题以包含
str(exprs(gset))的结果？ -
确保你在一个干净的 R 会话中开始（没有加载不必要的包等）
标签： r runtime-error