将数据导入 R 和 spatstat 时出错答案

【问题标题】：Error importing data into R and spatstat将数据导入 R 和 spatstat 时出错
【发布时间】：2013-03-02 01:58:49
【问题描述】：

我正在尝试将文本文件导入 R，特别是 spatstat 包。我已经加载了一个 shp 文件作为窗口并且工作得很好（使用 plot() 显示）。我无法运行 ppp() 命令。运行pp <- ppp(X, Y, window=W)

后我不断收到此错误

Error in ppp(X, Y, window = W) : 
  1 out of 904 coordinate values are NA or NaN

我仔细检查了文件，X 或 Y 坐标都没有任何空白数字甚至负数。

我应该检查什么来处理这个错误？此外，这些数据是公开的，因此如果他们需要查看，我可以将其提供给任何人。

【问题讨论】：

标签： r spatstat

【解决方案1】：

最好检查从文件加载的数据集而不是文件本身。 txt 中可能有很多难以用肉眼捕捉到的棘手内容、空格分隔符而不是制表符、末尾额外的 '\n' 等等。

试一试

which(is.nan(X))

看起来只有一个观察结果给您带来了问题。

【讨论】：

我想你的意思是is.nan。根据错误消息，他们可能也应该检查is.na。
如果 X 为无限值，这将不起作用。 any(is.infinite(X)) > 0
is.na 工作。第 904 行有一个错误，这就是为什么当有超过 2000 分时它给出 904 中的 1 分。那应该坦率地告诉我。有趣的是，问题在于文本字段中的撇号。非常感谢。

【解决方案2】：

我想要这样的：

ok <- is.finite(X) & is.finite(Y)
if(!ok){
    X <- X[is.finite(X)]
    Y <- Y[is.finite(Y)]
}
pp <- ppp(X, Y, window=W)

【讨论】：