通过 Shinyapps.io 连接到 MongoDB Atlas答案

【问题标题】：Connection to MongoDB Atlas via Shinyapps.io通过 Shinyapps.io 连接到 MongoDB Atlas
【发布时间】：2020-02-18 23:02:13
【问题描述】：

我尝试将闪亮的应用程序连接到 mongodb 服务器。我在 shinyapps.io 上部署了应用程序，但一次又一次地出错：

2019-10-22T18:14:14.694520+00:00 shinyapps[1117463]: Listening on http://127.0.0.1:36739
2019-10-22T18:14:36.665309+00:00 shinyapps[1117463]: Warning: Error in : No suitable servers found (`serverSelectionTryOnce` set): [socket timeout calling ismaster on 'seaport-shard-00-01-rysq4.gcp.mongodb.net:27017'] [socket timeout calling ismaster on 'seaport-shard-00-02-rysq4.gcp.mongodb.net:27017'] [socket timeout calling ismaster on 'seaport-shard-00-00-rysq4.gcp.mongodb.net:27017']
2019-10-22T18:14:36.670320+00:00 shinyapps[1117463]:   61: mongo_collection_command_simple
2019-10-22T18:14:36.670321+00:00 shinyapps[1117463]:   60: mongo
2019-10-22T18:14:36.670322+00:00 shinyapps[1117463]:   59: server [/srv/connect/apps/Seaport/app.R#223]
2019-10-22T18:14:36.670413+00:00 shinyapps[1117463]: Error : No suitable servers found (`serverSelectionTryOnce` set): [socket timeout calling ismaster on 'seaport-shard-00-01-rysq4.gcp.mongodb.net:27017'] [socket timeout calling ismaster on 'seaport-shard-00-02-rysq4.gcp.mongodb.net:27017'] [socket timeout calling ismaster on 'seaport-shard-00-00-rysq4.gcp.mongodb.net:27017']

更有趣的是，这个应用程序在我的 PC 上本地运行良好，而且过去 2 周在闪亮应用程序上运行良好。

我尝试使用标准连接字符串部署应用程序：

Data <- mongo(collection = 'Data',
              db = 'MaterialSeaport',
              url = 'mongodb+srv://<USER>:<PASSWORD>@seaport-rysq4.gcp.mongodb.net/test?retryWrites=true&w=majority')

添加 scram sha 选项：

Data <- mongo(collection = 'Data',
              db = 'MaterialSeaport',
              url = 'mongodb+srv://<USER>:<PASSWORD>@seaport-rysq4.gcp.mongodb.net/test?retryWrites=true&w=majority&authMechanism=SCRAM-SHA-1')

并且使用旧的连接字符串：

Data <- mongo(collection = 'Data',
              db = 'MaterialSeaport',
              url = 'mongodb://<USER>:<PASSWORD>@seaport-shard-00-00-rysq4.gcp.mongodb.net:27017,seaport-shard-00-01-rysq4.gcp.mongodb.net:27017,seaport-shard-00-02-rysq4.gcp.mongodb.net:27017/test?ssl=true&replicaSet=Seaport-shard-0&authSource=admin&retryWrites=true&w=majority')

如何在不出现此错误的情况下将我的应用程序与 mongodb 连接？

【问题讨论】：

我认为 shinyapps 有问题
您解决了吗？托管从 docker 容器调用 Atlas 的应用程序时遇到类似问题。
检查你的mongolite版本！在将我的 Dockerfile 中的 mongolite 版本从 1.5 升级到 2.2.0 之前，我尝试了 SO 和 Github 中的几乎所有内容...显然旧版本的 mongolite 难以连接到 Atlas 上的 Mongo 集群。

标签： r mongodb shiny shinyapps mongolite

【解决方案1】：

通过将 MongoDB Atlas 上的 shinyapps.io IP 列入白名单，我能够从 shinyapps.io 连接到 MongoDB Atlas。

登录 MongoDB Atlas
转到项目安全部分下的网络访问
点击“添加IP地址”，添加以下shinyapp.io IP：

54.204.34.9
54.204.36.75
54.204.37.78
34.203.76.245
3.217.214.132
34.197.152.155

这些 IP 地址可以在 [shinyapps.io Accessing Databases - Firewalls documentation][1] 中找到。文档中有在 AWS 上列入白名单的步骤，但概念是一样的。

祝你好运！

【讨论】：