修复多个警告“未知列”

Question

对于所有类型的命令（例如，用于在包上安装更新的 str(x)），我都有一个“未知列”的持续多次警告，并且不知道如何调试或修复它。

警告“未知列”显然与我重命名的 tbl_df 中的变量有关，但警告出现在看似与 tbl_df 无关的各种命令中（例如，在包上安装更新，str(x)其中 x 只是一个字符向量）。

Answer 1

我知道这是一个旧线程，但我在使用包sf 加载地理包格式的空间向量时遇到了同样的问题。使用as_tibble=FALSE 对我有用。该文件作为sp 对象加载，但一切仍然正常。正如@sabre 所提到的，尝试将对象强制放入tibble 似乎会在尝试索引不再存在的列时出现问题。

Answer 2

这是 RStudio 中的诊断工具（该工具在您的代码中显示警告和可能的错误）的问题。它在 RStudio v1.1.103 或更高版本中由 @kevin-ushey 部分修复为 commit。该修复是部分的，因为警告仍然出现（尽管频率较低）。此问题通过https://github.com/rstudio/rstudio/issues/7372 的可重现示例报告，并已在 RStudio v1.4 pull request 上修复。

更新到最新的 RStudio 版本以解决此问题。或者，有几种可用的解决方法，请选择您喜欢的解决方案：

• 禁用 Preferences/Code/Diagnostics 中所有文件的代码诊断

• 禁用特定文件的所有诊断：

  在打开的文件开头添加：

   # !diagnostics off
  

  然后保存文件，警告应该停止出现。

• 禁用导致警告的变量的诊断

  在打开的文件开头添加：

   # !diagnostics suppress=<comma-separated list of variables>
  

  然后保存文件，警告应该停止出现。

出现警告是因为 RStudio 中的诊断工具会解析源代码以检测错误，并且当它执行诊断检查时，它会访问 tibble 中未初始化的列，从而给出我们看到的警告。警告不会出现，因为您运行不相关的东西，它们会在执行 RStudio 诊断时出现（保存文件，然后修改，运行某些东西时......）。

Answer 3

当我在使用readr 包读取列后使用dplyr::rename 重命名列时收到这些警告。

spec 属性中未重命名列的旧名称。因此，删除 spec 属性会使警告消失。删除“spec_tbl_df”类似乎也是个好主意。

attr(dat, "spec") <- NULL
class(dat) <- setdiff(class(dat), "spec_tbl_df")

Answer 4

我在同时处理 tibble 和 lapply 函数时遇到了这个问题。小标题似乎将内容保存为数据框中的列表。

在将 lapply 函数的结果添加到 tibble 之前，我使用 unlist 解决了这个问题。

Answer 5

将课程转换为data.frame 为我解决了这个问题：

library(dplyr)
df <- data.frame(id = c(1,1:3), name = c("mary", "jo", "jill","steve"))
dfTbl <- df %>%
  group_by(id) %>%
  summarize (n = n())
class(dfTbl) # [1] "tbl_df"     "tbl"        "data.frame"
dfTbl = as.data.frame(dfTbl)
class(dfTbl) # [1] "data.frame"

从@adts 借来的部分脚本

Answer 6

我在使用“dplyr”包时遇到了这个问题。
对于那些在使用“dplyr”库中的“group_by”函数后遇到这个问题的人：

我发现取消分组变量可以解决未知列警告问题。有时我不得不多次迭代取消分组，直到问题得到解决。

Answer 7

假设我想选择以下列

best.columns = 'id'

对我来说，以下给出了警告：

df%>% select_(one_of(best.columns))

虽然这按预期工作，但据我所知dplyr，这应该是相同的。

df%>% select_(.dots = best.columns)

Answer 8

除了使用 dyplyr 块创建的 tibble 之外，我也遇到了这个问题。这是对 sabre 代码的轻微修改，以显示我是如何遇到同样错误的。

library(dplyr)

df <- data.frame(id = c(1,1:3), name = c("mary", "jo", "jill","steve"))

t <- df %>%
  group_by(id) %>%
  summarize (n = n())

t
str(t)


t$newvar[t$id==1] <- 0

Answer 9

我也遇到过同样的问题，虽然我不知道为什么会发生，但我已经能够确定什么时候发生，从而防止它不会发生。

问题似乎在于在基本 R 数据帧与在 tibble 数据帧中添加从索引派生的新列。以这个例子为例，您将一个新列 (age) 添加到基本 R 数据框：

base_df <- data.frame(id = c(1:3), name = c("mary", "jill","steve"))

base_df$age[base_df$name == "mary"] <- 47

这在不返回警告的情况下有效。但是，当对 tibble 执行相同操作时，它会引发警告（因此，我认为会导致奇怪的、看似无端的多重警告问题）：

library(tibble)

tibble_df <- tibble(id = c(1:3), name = c("mary", "jill","steve"))

tibble_df$age[tibble_df$name == "mary"] <- 47

Warning message:
Unknown column 'age' 

肯定有更好的方法来避免这种情况，但我发现首先创建一个NAs 的向量就可以了：

tibble_df$age <- NA

tibble_df$age[tibble_df$name == "mary"] <- 47