如何将 EndNote xml 文件放入 R 数据框中

Question

我希望将 EndNote 生成的 XML 文件放入 R 数据框中。

我希望每个最终的子节点（例如标题、作者...）成为一列

此处提供了一个示例 EndNote xml 文件：

Example on gist

我还没有使用库（XML）解决这个问题。我希望有人有现成的解决方案，如果这听起来很懒，请见谅。

Answer 1

我在转换为数据框时遇到了类似的问题。我在子节点上使用了xmlToDataFrame。

library(XML)
library(RCurl)
urldata<-"https://gist.github.com/raw/3831049/80f1315ba03d278b4f5f0d916fb1999709fc40e6/endnote.xml"
urldata<-xmlParse(getURL(urldata,ssl.verifypeer = FALSE,.opts=curlOptions(followlocation=TRUE)))
xmlToDataFrame(getNodeSet(urldata,'//*/record'))

#             database source-app rec-number foreign-keys ref-type
# 1 EndNote Ecology.enl    EndNote      13264        13264       17
# 2 EndNote Ecology.enl    EndNote      13265        13265       17
#        contributors                                  auth-address
# 1    Chapman, A. G. Cent States Forest Expt Stn, Columbus, OH USA
# 2 Strohecker, H. F.                 Univ Chicago, Chicago, IL USA
#                                                                                                     titles
# 1 An ecological basis for reforestation of submariginal lands in the Central Hardwood RegionEcologyEcology
# 2                                          A survey of soil temperatures in the Chicago areaEcologyEcology
#       periodical alt-periodical   pages volume number   dates      isbn
# 1 EcologyEcology EcologyEcology  93-105     18      1 1937Jan 0012-9658
# 2 EcologyEcology EcologyEcology 162-168     18      1 1937Jan 0012-9658
#         accession-num                                           notes
# 1 ISI:000200148800007  V02fg\rTimes Cited:5\rCited References Count:2
# 2 ISI:000200148800014 V02fg\rTimes Cited:5\rCited References Count:14
#                            urls language
# 1 <Go to ISI>://000200148800007  English
# 2 <Go to ISI>://000200148800014  English

如果一般使用可能需要多位作者的一些问题（此处不会发生）等，可能需要稍作改动。