我从事科学计算工作，并为多 CPU 系统开发基于 petsc 的应用程序。
出于调试目的，我想在我自己的电脑上安装那个软件，这是一个运行 Ubuntu (Karmic Koala) 的双核系统。
但我不知道要使用哪些资源。有 debian 软件包，以及网络上的源档案。我知道在编译和链接这些包的时候会有各种各样的问题，所以这个麻烦是我最想避免的！
我不关心性能（至少不是太多），因为我只会将这个软件用于调试，因此可用性对我来说是最重要的。
有人可以给点建议吗？
【问题讨论】：
标签： ubuntu mpi scientific-computing
如果存在本地（即 Ubuntu）包并且您没有任何特定理由不这样做，请使用它们。
【讨论】：
试试 CentOS。它基于 Red Hat Linux 并且是免费的。我们开发了科学的软件包，找到了方便调试和开发的环境。
【讨论】：
使用 Open MPI 或 MPICH2（从包管理器中获取），我更喜欢前者。如果你确定这个第三方项目的代码是坚如磐石的，那么你可以使用 Ubuntu 包，但是如果它大量使用 PETSc 并且你打算调试那个库，那么你应该在调试模式下构建你自己的 PETSc （仅打包版本优化）。
PETSc 仅在调试模式下进行大量完整性检查，包括
file:line function())。如果您正在调试客户端代码，这将节省大量时间。现在构建 PETSc 非常简单，但如果您有问题，请咨询 petsc-maint@mcs.anl.gov（无需订阅）或发送邮件至 petsc-users@mcs.anl.gov。
【讨论】：