如何使用 HPCToolkit 分析函数调用次数和挂钟时间？答案

【问题标题】：How to profile number of function calls and wall clock time using HPCToolkit?如何使用 HPCToolkit 分析函数调用次数和挂钟时间？
【发布时间】：2015-05-18 10:46:15
【问题描述】：

我打算在 8 个节点的集群上分析社区地球系统模型 (CESM)。我能够使用HPCToolkit 成功分析应用程序

我只能获得两个指标，即 CPU Time(I) 和 CPU Time(E)。我对获取函数调用次数和挂钟时间等指标很感兴趣。如何使用 HPCToolkit 提取此类指标？

这是所需的其他信息：

1) 系统信息

操作系统/架构 [nitin@master ~]$ uname -a Linux master.ipoc.org 2.6.32-358.el6.x86_64 #1 SMP Fri Feb 22 00:31:26 UTC 2013 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux

PAPI : 我还没有安装 PAPI。主要是因为在制作过程中遇到与安装有关的错误。我猜这是因为 http://icl.cs.utk.edu/papi/faq/#264 中所说的与 libpfm 相关的问题

Java [nitin@master ~]$ java -version java版本“1.7.0_09-icedtea” OpenJDK 运行时环境 (rhel-2.3.4.1.el6_3-x86_64) OpenJDK 64 位服务器 VM（内部版本 23.2-b09，混合模式）

2) 高性能计算工具包（看起来我使用的是 HPCToolkit 版本 5.3.2 [2012.09.21]。我认为这是 README.Releasenotes 中的最新版本）

3) 分析应用程序：该应用程序是一个复杂的应用程序，称为社区地球系统模型 (CESM)。它有几个组件分布在许多 fortan 文件中。代码主要在 Fortran 中。我没有使用 hpclink，而是直接在 mpirun 命令中使用 hpcrun。我在 8 个节点（每个节点有 16 个内核）的集群上运行代码。因此，看起来我已经动态链接了应用程序。

【问题讨论】：

我不确定 SO 是否适合这个平台（它对于问答网站来说太宽泛了）......也许你应该询问他们网站上提供的支持或论坛。跨度>
是的。确实如此。如网站中所述，我已在论坛中发布问题。除此之外，我想知道是否有一些 HPCToolkit 用户设法解决了这个问题。
“附加了 config.log”？
对不起。删除了该声明。这无关紧要。

标签： fortran profiling fortran90 hpc

【解决方案1】：

HPC Toolkit 不会为您提供函数调用的数量。它是基于采样的分析器，而不是“记录所有内容”分析器。

如果您需要知道确切的函数调用计数，那么您将需要检测代码或使用为回答您的问题而构建的其他东西，例如 gprof 或 callgrind（尽管对于 HPC 应用程序来说这样做并不容易或快速）。对于像 CESM 这样的代码，您可能不会从使用这些代码中获得任何收益。

对于挂钟，我希望它会提供此功能，因此建议您等待 HPC 工具包论坛回复您。

【讨论】：