将目录路径设置为 R 包中的动态链接库答案

【问题标题】：Setting a directory path to a dynamically linked library in an R package将目录路径设置为 R 包中的动态链接库
【发布时间】：2016-09-07 01:55:08
【问题描述】：

在编写 R 包时，加载动态链接库（即.so 文件）的正确方法是什么？到目前为止，唯一对我有用的解决方案是指定 .so 文件的完整路径，例如：

dyn.load('/FULL/PATH/TO/MY/R_PACKAGE/src/my_file.so')

显然，这种方法不适用于 CRAN/Bioconductor 提交，因为无法找到 .so 文件。因此，我（未成功）尝试了以下替代方案：

1) library.dynam()

2)library.dynam('my_file.so')

3)library.dynam('my_file.so', 'R_PACKAGE')

4) system.file("src", "my_file.so", package = "R_PACKAGE")

为了清楚起见，我的 R 包的用户显然可以在他们的计算机上设置任意工作目录。完整路径方法（如上所示）唯一可行的方法是将其工作目录设置为/FULL/PATH/TO/MY/R_PACKAGE/src，这（当然）是不切实际的。

【问题讨论】：

标签： c r dll

【解决方案1】：

如Writing R Extensions 中所述，执行此操作的标准方法是：

1.5.4 useDynLib

NAMESPACE 文件可以包含一个或多个 useDynLib 指令，这些指令允许需要加载的共享对象。* 指令

useDynLib(foo)

注册共享对象foo** 以使用library.dynam 加载。注册对象的加载发生在加载包代码之后和运行加载挂钩函数之前。只需要加载挂钩函数来加载共享对象的包可以改用useDynLib 指令。

* 注意：只有当包在 R 目录中包含 R 代码时，才会在所有版本的 R 中读取。 ** 请注意，这是共享对象的基本名称，并且会添加适当的扩展名（.so 或 .dll）。

【讨论】：

【解决方案2】：

快速点：

为什么需要发送.so 文件？这将阻止上传到不接受二进制内容的常见存储库（如 CRAN）
您可以使用system.file("src", "my_file.so", package="R_PACKAGE") 计算完整的/FULL/PATH/TO/MY/R_PACKAGE/src/my_file.so（但请确保您实际安装了非标准的src/）
在所有其他情况（正如@BenBolker 指出的那样）R 将知道如何创建动态库并为您加载它。每个带有编译代码的包都会这样做。只需将您的源代码放入src/，您就（基本上）完成了。

【讨论】：