python2.7.12 不包含 numpy 也不包含 pip 所以我无法在 gromacs 中运行我的程序

Question

我手动下载 Python 2.7.12，因为在我的魅力文件中 python2.7.15+ 不起作用。

在我的 Python 2.7.12 中没有 pip 命令，所以我无法安装 networkx 和 numpy 包。

我能做什么来跑步

python cgenff_charmm2gmx.py JZ4 jz4_fix.mol2 jz4.str charmm36-mar2019.ff

我正在尝试在我的 python 2.7.12 上增强 pip。但这也会报错：

suchi@DESKTOP-TR0BVV2:/mnt/c/Users/Microsoft/Desktop/Gromacs/Complex1$ python cgenff_charmm2gmx_py3.py UNK1 jz4_fix.mol2 jz4.str charmm36-jul2017.ff 回溯（最近一次通话最后）： 文件“cgenff_charmm2gmx_py3.py”，第 50 行，在 将 numpy 导入为 np ImportError：没有名为“numpy”的模块 suchi@DESKTOP-TR0BVV2:/mnt/c/Users/Microsoft/Desktop/Gromacs/Complex1$

============ DONE ============
Conversion complete.
The molecule topology has been written to jz4.itp
Additional parameters needed by the molecule are written to jz4.prm, which needs to be included in the system .top
============ DONE ============

Answer 1

您可以先手动安装 pip。下载get-pip.py然后执行 使用下面的命令。

# download the get-pip.py
wget https://bootstrap.pypa.io/get-pip.py

# use these 2 commands to make sure you have selected the right python
which python
python --version

# install pip, should work for both python2 and python3
python get-pip.py

然后，您几乎可以安装所需的所有软件包。 例如，

python -m pip install numpy

安装numpy。