将二部图转换为邻接矩阵 spark scala

Question

我正在尝试转换以下格式的边缘列表

data = [('a', 'developer'),
     ('b', 'tester'),
    ('b', 'developer'),
     ('c','developer'),
     ('c', 'architect')]

邻接矩阵的形式为

      developer     tester    architect
 a        1            0          0
 b        1            1          0
 c        1            0          1

我想将矩阵存储为以下格式

 1    0    0
 1    1    0
 1    0    1

我已经用 GraphX 试过了

def pageHash(title:String )  = title.toLowerCase.replace(" ","").hashCode.toLong


val edges: RDD[Edge[String]] = sc.textFile("/user/query.csv").map { line => 
  val row = line.split(",") 
  Edge(pageHash(row(0)), pageHash(row(1)), "1") 
} 
val graph: Graph[Int, String] = Graph.fromEdges(edges, defaultValue = 1)

我能够创建图形，但无法转换为相邻矩阵表示。

Answer 1

一种可能的方法是这样的：

1. 将RDD 转换为DataFrame

   val rdd = sc.parallelize(Seq(
     ("a", "developer"), ("b", "tester"), ("b", "developer"),
     ("c","developer"), ("c", "architect")))
   
   val df = rdd.toDF("row", "col")
   

2. 索引列：

   import org.apache.spark.ml.feature.StringIndexer
   
   val indexers = Seq("row", "col").map(x =>
     new StringIndexer().setInputCol(x).setOutputCol(s"${x}_idx").fit(df)
   )
   

3. 转换数据并创建RDD[MatrixEntry]：

   import org.apache.spark.functions.lit
   import org.apache.spark.mllib.linalg.distributed.{MatrixEntry, CoordinateMatrix}
   
   
   val entries = indexers.foldLeft(df)((df, idx) => idx.transform(df))
     .select($"row_idx", $"col_idx", lit(1.0))
     .as[MatrixEntry]  // Spark 1.6. For < 1.5 map manually
     .rdd
   

4. 创建矩阵

   new CoordinateMatrix(entries)
   

此矩阵可以进一步转换为任何其他类型的分布式矩阵，包括RowMatrix 和IndexedRowMatrix。